More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0575 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  100 
 
 
183 aa  352  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  57.14 
 
 
162 aa  168  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  52.14 
 
 
163 aa  159  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  47.68 
 
 
167 aa  156  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  53.49 
 
 
158 aa  154  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  46.26 
 
 
159 aa  154  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  47.5 
 
 
163 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  48.32 
 
 
158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  53.12 
 
 
158 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  51.94 
 
 
158 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  43.33 
 
 
170 aa  144  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  45.77 
 
 
165 aa  141  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  47.79 
 
 
147 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  47.48 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  48.53 
 
 
148 aa  137  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  43.84 
 
 
177 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  43.84 
 
 
177 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  43.84 
 
 
178 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  43.84 
 
 
171 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  42.77 
 
 
171 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  50.41 
 
 
164 aa  136  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  43.84 
 
 
171 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  46.76 
 
 
168 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  42.04 
 
 
178 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  43.15 
 
 
171 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  45.32 
 
 
164 aa  134  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  47.48 
 
 
164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  42.68 
 
 
175 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  42.68 
 
 
175 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  42.68 
 
 
175 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  42.68 
 
 
175 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  42.68 
 
 
175 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  42.68 
 
 
175 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  42.68 
 
 
175 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  43.8 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  42.47 
 
 
174 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  42.04 
 
 
175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  45.32 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  43.45 
 
 
161 aa  132  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  45.32 
 
 
165 aa  131  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  45.32 
 
 
165 aa  131  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  45.32 
 
 
168 aa  131  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  42.86 
 
 
154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  41.98 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  41.56 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  40.12 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  42.86 
 
 
173 aa  129  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  38.89 
 
 
192 aa  128  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  41.88 
 
 
518 aa  128  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  39.86 
 
 
178 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  45.32 
 
 
165 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  45.32 
 
 
165 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0757  CheW protein  43.42 
 
 
276 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  44.52 
 
 
165 aa  127  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  48.74 
 
 
165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  44.2 
 
 
262 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  47.8 
 
 
159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  36.91 
 
 
157 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  41.22 
 
 
165 aa  125  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  41.78 
 
 
165 aa  125  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  41.78 
 
 
165 aa  124  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0742  CheW protein  43.06 
 
 
275 aa  124  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  41.79 
 
 
163 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  39.19 
 
 
164 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  47.01 
 
 
179 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  37.84 
 
 
164 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  42.75 
 
 
163 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2307  CheW protein  45.71 
 
 
164 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  40.71 
 
 
167 aa  122  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  37.23 
 
 
145 aa  121  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  36.9 
 
 
174 aa  121  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.16 
 
 
164 aa  121  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  41.1 
 
 
165 aa  121  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  38.56 
 
 
169 aa  120  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  39.86 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  39.86 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  40.3 
 
 
238 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  39.86 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  37.78 
 
 
148 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2218  chemotaxis protein CheW  43.92 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  46.15 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  46.15 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  41.38 
 
 
164 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  39.33 
 
 
163 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  41.38 
 
 
164 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  42.11 
 
 
159 aa  119  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  36.91 
 
 
161 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  37.16 
 
 
164 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  40 
 
 
164 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.39 
 
 
164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  40.69 
 
 
159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.69 
 
 
159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  36.75 
 
 
174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  40.69 
 
 
159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  40.69 
 
 
159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  38.31 
 
 
218 aa  118  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  43.57 
 
 
159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  37.33 
 
 
167 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  37.33 
 
 
167 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  37.33 
 
 
167 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>