More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0932 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  100 
 
 		 165 aa  330  4e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  53.47 
 
 		 169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  43.87 
 
 		 175 aa  140  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  44.17 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  50 
 
 		 194 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  50 
 
 		 194 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  46.88 
 
 		 194 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  41.43 
 
 		 157 aa  127  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.96 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.14 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  40.26 
 
 		 178 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  41.13 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  41.13 
 
 		 192 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  41.84 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  41.73 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  39.72 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.13 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  41.01 
 
 		 169 aa  123  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  44.2 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  41.33 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  40.56 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.72 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  41.73 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  40 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  38.1 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  43.36 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  42.86 
 
 		 163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  39.16 
 
 		 179 aa  117  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  40.29 
 
 		 164 aa  117  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  33.13 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  39.16 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  43.48 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  36.59 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  37.58 
 
 		 173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  38.46 
 
 		 167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  37.72 
 
 		 179 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  36.91 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  36.88 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  39.01 
 
 		 187 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  39.01 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  31.71 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  39.16 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  39.74 
 
 		 163 aa  111  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  37.16 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  36.36 
 
 		 179 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  38.36 
 
 		 163 aa  111  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  32.05 
 
 		 159 aa  110  9e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  40.3 
 
 		 191 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  40.3 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  39.01 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  34.18 
 
 		 185 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  36.49 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  34.18 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  34.34 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  39.74 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  36.55 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  37.67 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  40.3 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  37.67 
 
 		 167 aa  108  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  33.55 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  38.41 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  37.76 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  34.81 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  43.7 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  33.76 
 
 		 181 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  33.97 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  33.13 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  43.9 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.52 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  34.75 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  36.25 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  33.55 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  37.75 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  36.05 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  34.39 
 
 		 171 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  34.93 
 
 		 174 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  34.39 
 
 		 177 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  34.39 
 
 		 177 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  45.31 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  35.76 
 
 		 162 aa  104  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  34.69 
 
 		 162 aa  104  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  36.3 
 
 		 171 aa  103  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  34.87 
 
 		 171 aa  104  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  34 
 
 		 171 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  35.03 
 
 		 163 aa  103  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  35.62 
 
 		 166 aa  103  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  36.17 
 
 		 164 aa  103  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  32.43 
 
 		 163 aa  103  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.53 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  32.48 
 
 		 161 aa  103  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  34.53 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  34.53 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  31.82 
 
 		 163 aa  103  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  34.53 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  32.28 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  38.41 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  38.46 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  38 
 
 		 218 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  32.28 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  38.41 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>