More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2572 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  100 
 
 
185 aa  360  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  98.38 
 
 
185 aa  355  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  89.73 
 
 
181 aa  318  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  55.13 
 
 
163 aa  197  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  54.78 
 
 
164 aa  187  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  52.07 
 
 
178 aa  186  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  54.14 
 
 
164 aa  186  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  53.5 
 
 
157 aa  186  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  54.49 
 
 
164 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  54.14 
 
 
164 aa  186  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  54.9 
 
 
164 aa  184  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  52.47 
 
 
162 aa  184  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  54.97 
 
 
164 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  51.23 
 
 
171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  51.68 
 
 
169 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  53.21 
 
 
167 aa  178  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  50.98 
 
 
179 aa  158  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  46.94 
 
 
164 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  48 
 
 
167 aa  153  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  46.63 
 
 
173 aa  150  8e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  48.05 
 
 
161 aa  150  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  46.71 
 
 
161 aa  149  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  49.32 
 
 
163 aa  149  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  49.69 
 
 
160 aa  148  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  43.23 
 
 
169 aa  145  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  43.2 
 
 
194 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  44 
 
 
194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  44.37 
 
 
185 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  44 
 
 
192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  42.11 
 
 
194 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  42.11 
 
 
194 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  42.95 
 
 
179 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  42.04 
 
 
179 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  44.9 
 
 
194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  40.13 
 
 
185 aa  129  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  40.67 
 
 
180 aa  128  4.0000000000000003e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  44.68 
 
 
179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  38.67 
 
 
176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  36.94 
 
 
187 aa  124  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.54 
 
 
178 aa  123  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  42.42 
 
 
163 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  41.26 
 
 
170 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  48.12 
 
 
169 aa  121  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  41.01 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  37.58 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  42.11 
 
 
171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  37.82 
 
 
166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  37.66 
 
 
162 aa  117  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  42.5 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  39.6 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  39.47 
 
 
164 aa  115  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  42.57 
 
 
160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  38.36 
 
 
174 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  36.54 
 
 
156 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  41.26 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  38.36 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  38.1 
 
 
162 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  41.26 
 
 
157 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  35.95 
 
 
163 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  39.75 
 
 
167 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  37.32 
 
 
159 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  36.88 
 
 
175 aa  111  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  32.47 
 
 
169 aa  111  8.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  36.02 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  38.62 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  44.96 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  36.25 
 
 
174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  34.18 
 
 
165 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  35.85 
 
 
171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  36.49 
 
 
161 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  35.62 
 
 
175 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  35.62 
 
 
175 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  35.62 
 
 
175 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  35.62 
 
 
175 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  35.62 
 
 
178 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  35.62 
 
 
175 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  35.62 
 
 
175 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  35.62 
 
 
175 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  35.62 
 
 
175 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  36.99 
 
 
162 aa  107  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  41.1 
 
 
158 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  36.25 
 
 
159 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.25 
 
 
159 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  37.59 
 
 
166 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  36.25 
 
 
159 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  35.48 
 
 
165 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  33.73 
 
 
179 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  38.73 
 
 
163 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  38.73 
 
 
163 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  37.41 
 
 
164 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.49 
 
 
164 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  36.25 
 
 
159 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  36.73 
 
 
163 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  38.03 
 
 
163 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  43.41 
 
 
191 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  32.47 
 
 
163 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  37.75 
 
 
158 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  35 
 
 
175 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  36.49 
 
 
164 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  36.18 
 
 
177 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>