More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2314 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  100 
 
 		 165 aa  326  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  66.87 
 
 		 163 aa  216  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  77.86 
 
 		 166 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  56.77 
 
 		 163 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  54.93 
 
 		 157 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  51.06 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  49.01 
 
 		 171 aa  149  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  49.66 
 
 		 160 aa  144  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  51.06 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  43.24 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  44.23 
 
 		 169 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  44.23 
 
 		 169 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  42.94 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  44.6 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  41.91 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  40.14 
 
 		 163 aa  120  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  43.36 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  41.78 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  38.89 
 
 		 183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  38 
 
 		 178 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  39.86 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  38 
 
 		 178 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  37.66 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  36.42 
 
 		 174 aa  117  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  35.4 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  38.78 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  43.38 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  36.08 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  38.78 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  38.1 
 
 		 177 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  38.1 
 
 		 177 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  39.38 
 
 		 179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  38.1 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  42.76 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  38.1 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  38.78 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  37.11 
 
 		 171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  37.33 
 
 		 175 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  37.41 
 
 		 171 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  41.04 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  37.41 
 
 		 174 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  45.58 
 
 		 194 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  45.14 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  45.14 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0038  chemotaxis protein cheW  60 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  40.14 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  35.21 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  37.34 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  38.73 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  38.67 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  37.16 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  37.32 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  34.03 
 
 		 169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  36.73 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  36.73 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  36.73 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  36.73 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  41.1 
 
 		 150 aa  111  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  36.73 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  36.73 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  36.73 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  35.21 
 
 		 165 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  36.73 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  37.27 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  37.16 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  38.03 
 
 		 167 aa  110  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  38.03 
 
 		 167 aa  110  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  38.03 
 
 		 167 aa  110  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  38.03 
 
 		 167 aa  110  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  38.03 
 
 		 167 aa  110  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  38.03 
 
 		 167 aa  110  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  38.03 
 
 		 167 aa  110  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  35.21 
 
 		 170 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  35.21 
 
 		 164 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  38.03 
 
 		 167 aa  110  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  35.21 
 
 		 164 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  40.41 
 
 		 162 aa  110  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  34.84 
 
 		 176 aa  110  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  40.43 
 
 		 164 aa  110  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  36.54 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  36.81 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  36.05 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  33.96 
 
 		 170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.21 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  39.86 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  42.97 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  39.86 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  34.51 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  36.94 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  41.98 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  35.62 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  38.1 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.13 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  36.24 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  36.73 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  37.24 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  36.73 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.33 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  38.03 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  36.13 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>