More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1831 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  100 
 
 
168 aa  339  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  67.66 
 
 
167 aa  231  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  65.48 
 
 
168 aa  224  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  64.02 
 
 
165 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  62.65 
 
 
165 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  64.02 
 
 
165 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  67.35 
 
 
164 aa  209  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  64.05 
 
 
164 aa  207  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  61.31 
 
 
165 aa  204  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  61.31 
 
 
165 aa  204  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  62.99 
 
 
164 aa  204  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  59.33 
 
 
165 aa  194  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  58.14 
 
 
169 aa  158  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  51.33 
 
 
158 aa  157  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  54.92 
 
 
158 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  54.92 
 
 
158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  54.92 
 
 
158 aa  143  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  49.65 
 
 
162 aa  143  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  46 
 
 
189 aa  140  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  49.6 
 
 
165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  41.06 
 
 
167 aa  137  7e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  51.59 
 
 
164 aa  134  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  44.14 
 
 
163 aa  133  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  44.44 
 
 
170 aa  133  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2578  purine-binding chemotaxis protein CheW  53.33 
 
 
126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  45.32 
 
 
183 aa  131  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  42 
 
 
163 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  44.79 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  46.67 
 
 
147 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  42.47 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  42.96 
 
 
141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  42.07 
 
 
159 aa  128  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  42.14 
 
 
163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  42.66 
 
 
163 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  42.66 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.82 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  38.93 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  44.59 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  40.82 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  40.82 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  40.82 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  41.96 
 
 
164 aa  125  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  40.82 
 
 
164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3975  CheW protein  42.25 
 
 
141 aa  124  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000746819 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  40 
 
 
164 aa  124  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  44.85 
 
 
148 aa  124  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  40 
 
 
162 aa  124  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  39.74 
 
 
168 aa  123  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  41.1 
 
 
159 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  41.22 
 
 
164 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  40.14 
 
 
164 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  40.26 
 
 
164 aa  122  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  40.69 
 
 
159 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  39.47 
 
 
161 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  43.17 
 
 
163 aa  122  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  38.56 
 
 
159 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  43.62 
 
 
533 aa  121  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  38.56 
 
 
159 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  41.89 
 
 
169 aa  121  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  39.46 
 
 
164 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  39.46 
 
 
164 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  39.46 
 
 
164 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  39.46 
 
 
164 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  40.54 
 
 
164 aa  121  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  38.57 
 
 
169 aa  120  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  48.97 
 
 
159 aa  120  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  41.48 
 
 
139 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  38.57 
 
 
171 aa  120  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  38.82 
 
 
159 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.82 
 
 
159 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.69 
 
 
174 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  39.74 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  38.82 
 
 
159 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  38.82 
 
 
159 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  36.73 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  46.62 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  37.41 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  37.34 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  41.55 
 
 
159 aa  118  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.29 
 
 
164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  43.7 
 
 
136 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  40.43 
 
 
159 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  37.41 
 
 
160 aa  117  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  40.54 
 
 
164 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  38.41 
 
 
185 aa  117  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  38.41 
 
 
164 aa  117  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  40.14 
 
 
518 aa  117  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.84 
 
 
164 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  40.54 
 
 
218 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  35.92 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  36.05 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  35.37 
 
 
175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  38.51 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  39.6 
 
 
163 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  39.16 
 
 
169 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  35.26 
 
 
171 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  35.42 
 
 
166 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  38.62 
 
 
161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.85 
 
 
164 aa  114  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  34.01 
 
 
177 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>