More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2322 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  100 
 
 		 533 aa  1043    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  49.03 
 
 		 568 aa  414  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  40.36 
 
 		 520 aa  360  3e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  43.63 
 
 		 531 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  36 
 
 		 515 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  34.99 
 
 		 518 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  37.3 
 
 		 479 aa  206  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  26.05 
 
 		 478 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0761  CheW protein  31.58 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.951826  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  25.05 
 
 		 528 aa  131  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  48.59 
 
 		 168 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  43.62 
 
 		 168 aa  121  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  45.33 
 
 		 164 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  47.18 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  45.45 
 
 		 164 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  44.3 
 
 		 163 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  46.85 
 
 		 163 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  53.85 
 
 		 166 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  39.35 
 
 		 165 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  53.21 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  43.15 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  42.76 
 
 		 158 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  53.21 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  41.38 
 
 		 183 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  53.21 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  42.95 
 
 		 165 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  42.95 
 
 		 165 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  41.5 
 
 		 159 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  42 
 
 		 167 aa  107  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  39.07 
 
 		 167 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  53.33 
 
 		 169 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  45.99 
 
 		 163 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  41.61 
 
 		 165 aa  107  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  43.66 
 
 		 147 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  44.2 
 
 		 159 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  51.4 
 
 		 165 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  48.36 
 
 		 164 aa  105  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  39.51 
 
 		 165 aa  104  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  37.32 
 
 		 145 aa  104  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  39.86 
 
 		 162 aa  104  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  39.74 
 
 		 170 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  39.74 
 
 		 170 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  39.74 
 
 		 170 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  39.46 
 
 		 163 aa  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  39.74 
 
 		 170 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  39.74 
 
 		 170 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  39.74 
 
 		 170 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  39.74 
 
 		 158 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  38.93 
 
 		 164 aa  103  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  39.74 
 
 		 158 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  41.61 
 
 		 148 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  39.87 
 
 		 163 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  39.61 
 
 		 165 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  39.61 
 
 		 165 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  36.57 
 
 		 164 aa  100  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  39.44 
 
 		 164 aa  100  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.57 
 
 		 164 aa  100  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  38.26 
 
 		 163 aa  100  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  39.04 
 
 		 163 aa  100  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  37.66 
 
 		 174 aa  100  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  39.04 
 
 		 163 aa  100  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  38.41 
 
 		 139 aa  100  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  39.47 
 
 		 165 aa  99.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  36 
 
 		 164 aa  99  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  37.01 
 
 		 163 aa  99.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  39.19 
 
 		 161 aa  99  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  36 
 
 		 164 aa  99  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  36 
 
 		 164 aa  99  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  37.93 
 
 		 187 aa  99.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  36 
 
 		 164 aa  99  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  36.91 
 
 		 175 aa  98.6  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  38.36 
 
 		 163 aa  98.6  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  36.91 
 
 		 175 aa  98.6  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  36.91 
 
 		 175 aa  98.6  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  36.91 
 
 		 175 aa  98.6  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  36.91 
 
 		 175 aa  98.6  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  37.59 
 
 		 170 aa  98.2  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  36.91 
 
 		 175 aa  98.6  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  38.93 
 
 		 161 aa  98.6  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  36.91 
 
 		 175 aa  98.6  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  39.46 
 
 		 163 aa  97.8  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  40.14 
 
 		 165 aa  97.8  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  39.04 
 
 		 161 aa  97.8  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  40.14 
 
 		 165 aa  97.8  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0206  CheW domain protein  40 
 
 		 164 aa  97.4  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00161643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  38.51 
 
 		 218 aa  97.8  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  38.51 
 
 		 159 aa  97.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  36.24 
 
 		 175 aa  97.4  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  36.24 
 
 		 174 aa  97.4  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  38.96 
 
 		 165 aa  97.1  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  39.6 
 
 		 174 aa  97.1  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  36.77 
 
 		 162 aa  97.1  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  39.33 
 
 		 166 aa  97.1  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  35.57 
 
 		 171 aa  97.1  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  37.75 
 
 		 167 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  37.75 
 
 		 167 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  37.75 
 
 		 167 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  37.75 
 
 		 167 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  37.75 
 
 		 167 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  37.75 
 
 		 167 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>