More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3304 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  100 
 
 		 479 aa  907    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  40.98 
 
 		 531 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  35.85 
 
 		 533 aa  243  5e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  35.29 
 
 		 568 aa  221  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  28.6 
 
 		 520 aa  189  8e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  29.32 
 
 		 518 aa  169  9e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  28.14 
 
 		 515 aa  164  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0761  CheW protein  35.39 
 
 		 475 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.951826  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2054  CheW protein  35.05 
 
 		 429 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.665842  hitchhiker  0.000288851 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  20.7 
 
 		 478 aa  124  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  38.67 
 
 		 167 aa  106  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  32.24 
 
 		 165 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  37.24 
 
 		 163 aa  104  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  26.03 
 
 		 528 aa  103  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  32.05 
 
 		 163 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  32.48 
 
 		 169 aa  94.4  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  41.03 
 
 		 165 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  40 
 
 		 165 aa  93.6  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  42.74 
 
 		 164 aa  93.6  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  35.94 
 
 		 169 aa  93.6  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  32.62 
 
 		 164 aa  93.2  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  38.46 
 
 		 158 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  34.72 
 
 		 189 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  32.21 
 
 		 162 aa  91.3  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  30.12 
 
 		 163 aa  90.9  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  31.47 
 
 		 168 aa  90.5  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.59 
 
 		 164 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  34.13 
 
 		 165 aa  89.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  37.5 
 
 		 158 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  30.9 
 
 		 163 aa  88.6  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  42.02 
 
 		 166 aa  89  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  37.61 
 
 		 158 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  36.54 
 
 		 168 aa  89  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  32.48 
 
 		 162 aa  88.6  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  36.36 
 
 		 161 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  31.37 
 
 		 163 aa  87.8  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  31.76 
 
 		 167 aa  86.7  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  38.46 
 
 		 170 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  38.46 
 
 		 170 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  38.46 
 
 		 158 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  32.65 
 
 		 164 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  38.46 
 
 		 170 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  40 
 
 		 169 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  32.65 
 
 		 164 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  38.46 
 
 		 170 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  32.65 
 
 		 170 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  39 
 
 		 164 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  38.46 
 
 		 170 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  38.46 
 
 		 170 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  33.55 
 
 		 158 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  33.56 
 
 		 163 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  31.97 
 
 		 165 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  33.54 
 
 		 158 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  29.75 
 
 		 159 aa  85.9  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  33.6 
 
 		 159 aa  85.9  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  31.86 
 
 		 166 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  33.33 
 
 		 167 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  32.93 
 
 		 162 aa  85.5  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  33.33 
 
 		 165 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  33.33 
 
 		 165 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  33.33 
 
 		 165 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  41.67 
 
 		 175 aa  85.1  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  33.33 
 
 		 159 aa  84.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  35.29 
 
 		 167 aa  84.7  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  33.1 
 
 		 170 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  32.65 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  36.28 
 
 		 160 aa  84.3  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  30.86 
 
 		 170 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  32.46 
 
 		 148 aa  84  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2218  chemotaxis protein CheW  46.23 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  36.97 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  38 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  33.13 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  35.78 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  35.78 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  35.78 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  34.64 
 
 		 167 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  34.64 
 
 		 167 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  28.87 
 
 		 163 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  34.64 
 
 		 167 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  34.64 
 
 		 167 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  35.78 
 
 		 171 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  31.18 
 
 		 175 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  31.18 
 
 		 175 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  31.68 
 
 		 164 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  31.18 
 
 		 175 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  34.64 
 
 		 167 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  34.64 
 
 		 167 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  31.18 
 
 		 175 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  31.18 
 
 		 175 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  34.64 
 
 		 167 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  31.48 
 
 		 174 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  31.18 
 
 		 175 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  35.78 
 
 		 171 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  31.18 
 
 		 175 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  34.64 
 
 		 167 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  31.18 
 
 		 175 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  37.27 
 
 		 166 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  32.65 
 
 		 164 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  35.19 
 
 		 145 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>