More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2054 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2054  CheW protein  100 
 
 		 429 aa  751    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.665842  hitchhiker  0.000288851 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0761  CheW protein  47.8 
 
 		 475 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.951826  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  33.95 
 
 		 479 aa  133  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  33.86 
 
 		 531 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  27.8 
 
 		 533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  26.23 
 
 		 518 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  24.15 
 
 		 520 aa  99.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  27.79 
 
 		 568 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  25.35 
 
 		 515 aa  90.5  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  17.8 
 
 		 478 aa  89.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  20.19 
 
 		 528 aa  85.1  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  36.36 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  34.38 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  37.61 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.61 
 
 		 164 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  35.35 
 
 		 161 aa  61.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  28.91 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.67 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.61 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  29.5 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  30.83 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  32.2 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  31.25 
 
 		 158 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  32.14 
 
 		 185 aa  58.9  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  31.15 
 
 		 201 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  29.17 
 
 		 179 aa  58.9  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  26.95 
 
 		 146 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  33.02 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.97 
 
 		 164 aa  57  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  31.58 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  31.37 
 
 		 168 aa  57  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  31.58 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  27.8 
 
 		 870 aa  57  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  35.35 
 
 		 174 aa  57  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  47.25 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  33.61 
 
 		 163 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  29.52 
 
 		 162 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  33.65 
 
 		 164 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  28.15 
 
 		 178 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0150  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.58 
 
 		 153 aa  55.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  29.03 
 
 		 178 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  29.46 
 
 		 183 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.29 
 
 		 159 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  40.34 
 
 		 154 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  32.29 
 
 		 159 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  32.29 
 
 		 159 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  30.47 
 
 		 139 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  28.1 
 
 		 166 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  32.29 
 
 		 159 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  38.02 
 
 		 163 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  29.9 
 
 		 181 aa  54.3  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  32.99 
 
 		 159 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  28.1 
 
 		 161 aa  54.3  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  32.99 
 
 		 159 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  34.34 
 
 		 164 aa  54.3  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  31.93 
 
 		 157 aa  53.9  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  29.41 
 
 		 155 aa  53.9  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0654  putative CheW protein  35.29 
 
 		 169 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  29.67 
 
 		 189 aa  53.5  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.23 
 
 		 174 aa  53.5  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2883  CheW protein  30 
 
 		 177 aa  53.5  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325772  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  35.23 
 
 		 164 aa  53.5  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  32.29 
 
 		 159 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  32.29 
 
 		 159 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  28 
 
 		 163 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  32.61 
 
 		 159 aa  53.1  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  32.09 
 
 		 150 aa  53.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  32.81 
 
 		 184 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0468  putative CheW protein  38.46 
 
 		 186 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0754564  normal  0.870958 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  34.09 
 
 		 163 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  28.57 
 
 		 164 aa  52.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  47.83 
 
 		 212 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  30.77 
 
 		 164 aa  52.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  33.06 
 
 		 185 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  47.87 
 
 		 212 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  30.56 
 
 		 159 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  28.97 
 
 		 164 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  35.05 
 
 		 136 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  35.71 
 
 		 152 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  28.87 
 
 		 160 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5006  CheW protein  39.09 
 
 		 147 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  31.96 
 
 		 149 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  28.69 
 
 		 163 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  30.84 
 
 		 165 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  28.95 
 
 		 163 aa  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  33.68 
 
 		 146 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  29.92 
 
 		 174 aa  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  31.48 
 
 		 175 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  25.47 
 
 		 165 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1325  CheW protein  36 
 
 		 161 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.68 
 
 		 164 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  34.09 
 
 		 162 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  30.84 
 
 		 165 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  33.68 
 
 		 146 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1586  chemotaxis protein, CheW3  43.33 
 
 		 178 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  31.19 
 
 		 157 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  32.26 
 
 		 187 aa  51.2  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0266  putative CheW protein  40.22 
 
 		 177 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.452082 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0238  putative CheW protein  43.33 
 
 		 178 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  23.64 
 
 		 148 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>