More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0236 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  100 
 
 		 158 aa  322  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  76.77 
 
 		 155 aa  248  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  76.77 
 
 		 155 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  66.45 
 
 		 155 aa  227  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  70.83 
 
 		 161 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  68.49 
 
 		 154 aa  210  5.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  65 
 
 		 159 aa  208  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  61.27 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  50.97 
 
 		 154 aa  177  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  50.32 
 
 		 154 aa  174  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  49.35 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  49.35 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  56.38 
 
 		 152 aa  171  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  56.38 
 
 		 152 aa  171  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  58.96 
 
 		 152 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  51.43 
 
 		 159 aa  167  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  50.71 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  50.71 
 
 		 158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  53.64 
 
 		 155 aa  160  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  50.71 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  50 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  51.49 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  48.25 
 
 		 157 aa  137  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  42.86 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  41.01 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  43.23 
 
 		 155 aa  120  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  36.43 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  36.96 
 
 		 163 aa  117  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  37.24 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  36.24 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  36.96 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.96 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  36.96 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  36.96 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  33.11 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  34.23 
 
 		 163 aa  114  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  34.46 
 
 		 183 aa  114  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  33.11 
 
 		 170 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  33.11 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  37.96 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  36.96 
 
 		 159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  36.96 
 
 		 159 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  33.55 
 
 		 164 aa  113  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  32.45 
 
 		 165 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  32.91 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  34.78 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  34.78 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  33.33 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  34.01 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  34.01 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0150  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.09 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  34.78 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  35.51 
 
 		 163 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  33.55 
 
 		 162 aa  111  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  33.55 
 
 		 162 aa  111  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  33.33 
 
 		 177 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  35.51 
 
 		 163 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  33.33 
 
 		 177 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  33.33 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  33.33 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  34.44 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  35.71 
 
 		 164 aa  110  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  33.55 
 
 		 174 aa  110  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  33.55 
 
 		 167 aa  110  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  33.55 
 
 		 167 aa  110  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  34.29 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  34.29 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  33.55 
 
 		 167 aa  110  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  34.29 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  34.29 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  34.29 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  34.29 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  33.55 
 
 		 167 aa  110  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  33.55 
 
 		 167 aa  110  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  34.29 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  33.55 
 
 		 167 aa  110  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  33.55 
 
 		 167 aa  110  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  33.55 
 
 		 167 aa  110  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  34.06 
 
 		 170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  36.36 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3496  biotin synthase  33.78 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.296204  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  34.33 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  33.57 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  34.29 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  36.69 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  32.65 
 
 		 178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.51 
 
 		 174 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  33.33 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  31.58 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.61 
 
 		 170 aa  107  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  32.26 
 
 		 167 aa  107  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  35.51 
 
 		 162 aa  107  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  34.29 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  34.06 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  34.29 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  41.61 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  34.29 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  33.57 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  35.82 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  33.57 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>