More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3106 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  100 
 
 		 187 aa  377  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  58.82 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  57.52 
 
 		 183 aa  186  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0165  CheW protein  53.53 
 
 		 183 aa  175  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  49.45 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3496  biotin synthase  58.39 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.296204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  54.86 
 
 		 163 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  54.86 
 
 		 163 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  55.4 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  55.4 
 
 		 158 aa  157  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  50.34 
 
 		 175 aa  151  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  51.41 
 
 		 166 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  49.66 
 
 		 174 aa  150  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  52.14 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  56.52 
 
 		 160 aa  150  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  49.66 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  49.66 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  49.66 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  49.66 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  49.66 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  49.66 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  49.66 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  49.66 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  46.54 
 
 		 177 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  46.54 
 
 		 177 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  47.44 
 
 		 165 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  50 
 
 		 183 aa  148  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  46.54 
 
 		 171 aa  148  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  46.54 
 
 		 171 aa  148  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  48.99 
 
 		 171 aa  148  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  47.44 
 
 		 164 aa  148  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  46.75 
 
 		 170 aa  147  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  46.75 
 
 		 164 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  49.1 
 
 		 163 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  46.75 
 
 		 164 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  44.51 
 
 		 178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  46.2 
 
 		 174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  48.39 
 
 		 174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  44.51 
 
 		 178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  52.9 
 
 		 164 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  48.95 
 
 		 171 aa  145  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  52.17 
 
 		 162 aa  144  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  50 
 
 		 175 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  51.8 
 
 		 164 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  50 
 
 		 162 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  50.72 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  50 
 
 		 162 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  48.95 
 
 		 169 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  48.3 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  50 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  52.78 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  48.3 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  52.78 
 
 		 170 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  52.78 
 
 		 170 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  44.83 
 
 		 156 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  52.78 
 
 		 170 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  52.78 
 
 		 170 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  52.78 
 
 		 170 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  52.78 
 
 		 170 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  48.3 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  48.3 
 
 		 166 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  46.3 
 
 		 165 aa  141  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  43.27 
 
 		 170 aa  141  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  45.68 
 
 		 165 aa  140  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  46 
 
 		 160 aa  140  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  46.1 
 
 		 170 aa  140  9e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  44.81 
 
 		 170 aa  140  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  51.41 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  44.81 
 
 		 170 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  47.3 
 
 		 165 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  47.3 
 
 		 165 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  46.41 
 
 		 167 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  46.41 
 
 		 167 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  46.41 
 
 		 167 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  44.44 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  46.41 
 
 		 167 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  46.41 
 
 		 167 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  46.41 
 
 		 167 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  46.41 
 
 		 167 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  48.3 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  44.65 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  46.41 
 
 		 167 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  42.86 
 
 		 175 aa  137  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  42.11 
 
 		 187 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  45.75 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  43.27 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  43.27 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  43.27 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  43.27 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  43.27 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  47.3 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  47.14 
 
 		 174 aa  134  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  40.76 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  47.83 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0728  CheW protein  40.24 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000233542  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0755  CheW protein  49.65 
 
 		 176 aa  131  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  44.06 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0149  purine-binding chemotaxis protein CheW  42.35 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  43.98 
 
 		 174 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1476  CheW protein  46.2 
 
 		 185 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.331722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>