More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2092 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  100 
 
 		 170 aa  339  9e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  99.41 
 
 		 170 aa  338  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  99.41 
 
 		 170 aa  336  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  89.41 
 
 		 170 aa  308  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  92.59 
 
 		 164 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  91.98 
 
 		 165 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  92.59 
 
 		 164 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  85.29 
 
 		 170 aa  295  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  76.39 
 
 		 160 aa  229  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  61.64 
 
 		 167 aa  197  7e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  56.52 
 
 		 174 aa  193  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  56.52 
 
 		 174 aa  193  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  59.03 
 
 		 171 aa  187  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  57.64 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  61.54 
 
 		 167 aa  185  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  56.95 
 
 		 174 aa  185  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  58.74 
 
 		 163 aa  184  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  55.03 
 
 		 169 aa  182  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  59.03 
 
 		 174 aa  181  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  52.2 
 
 		 163 aa  181  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  57.34 
 
 		 163 aa  181  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  57.34 
 
 		 163 aa  181  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  57.34 
 
 		 163 aa  181  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  59.59 
 
 		 165 aa  180  8.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  57.86 
 
 		 160 aa  180  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  59.72 
 
 		 165 aa  179  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  59.72 
 
 		 165 aa  179  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  52.8 
 
 		 171 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  53.12 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  52.8 
 
 		 171 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  53.12 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  59.03 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  59.03 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  59.03 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  59.03 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  59.03 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  59.03 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  53.75 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  59.03 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  59.03 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  53.75 
 
 		 175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  53.75 
 
 		 175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  53.75 
 
 		 175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  57.64 
 
 		 171 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  57.64 
 
 		 171 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  53.75 
 
 		 175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  57.64 
 
 		 178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  53.7 
 
 		 178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  53.75 
 
 		 175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  53.75 
 
 		 175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  53.75 
 
 		 175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  53.46 
 
 		 187 aa  177  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  58.74 
 
 		 167 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  58.9 
 
 		 164 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  58.74 
 
 		 167 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  58.74 
 
 		 167 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  57.64 
 
 		 175 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  58.74 
 
 		 167 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  58.74 
 
 		 167 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  58.33 
 
 		 165 aa  177  7e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  58.33 
 
 		 166 aa  177  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  58.33 
 
 		 165 aa  176  9e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  58.33 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  56.85 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  58.33 
 
 		 167 aa  174  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  56.94 
 
 		 165 aa  173  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  52.76 
 
 		 164 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  54.79 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  53.64 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  54.43 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  55.17 
 
 		 162 aa  168  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  54.93 
 
 		 162 aa  167  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  53.95 
 
 		 170 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  53.95 
 
 		 170 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  53.95 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  53.95 
 
 		 170 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  53.95 
 
 		 170 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  53.95 
 
 		 170 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  53.95 
 
 		 170 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  52.48 
 
 		 162 aa  164  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  52.48 
 
 		 162 aa  164  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0257  putative purine-binding chemotaxis protein  60.84 
 
 		 161 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02230  putative purine-binding chemotaxis protein  60.84 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  55.56 
 
 		 174 aa  160  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  52.45 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  52.21 
 
 		 158 aa  158  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  52.82 
 
 		 174 aa  157  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  53.19 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  49.64 
 
 		 183 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1476  CheW protein  52.63 
 
 		 185 aa  150  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.331722  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1759  putative CheW protein  54.17 
 
 		 168 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1963  CheW protein  53.47 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.187208  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3125  CheW protein  52.82 
 
 		 169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  48.25 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  46.05 
 
 		 205 aa  144  6e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3496  biotin synthase  48.57 
 
 		 179 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.296204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00413  purine-binding chemotaxis protein CheW  69.7 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497597  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  44.81 
 
 		 187 aa  140  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  42.68 
 
 		 183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  37.65 
 
 		 218 aa  131  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>