More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0637 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  100 
 
 		 150 aa  305  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  49.3 
 
 		 155 aa  157  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  50 
 
 		 158 aa  156  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  48.59 
 
 		 155 aa  155  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  48.61 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  49.3 
 
 		 155 aa  154  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  47.18 
 
 		 155 aa  151  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  47.92 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  48.53 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  48.53 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  44.76 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  44.76 
 
 		 156 aa  143  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  44.76 
 
 		 156 aa  143  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  44.22 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  47.79 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  44.06 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  44 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  48.89 
 
 		 155 aa  139  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  42.96 
 
 		 158 aa  129  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  45.19 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  43.7 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  42.96 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  41.73 
 
 		 175 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  42.96 
 
 		 157 aa  123  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  34.53 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  38.52 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.15 
 
 		 170 aa  114  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  41.13 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  37.75 
 
 		 185 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  35.76 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  42.11 
 
 		 163 aa  111  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  40.74 
 
 		 187 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  35.71 
 
 		 170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  35.71 
 
 		 170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  34.35 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  34.35 
 
 		 170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  34.35 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  33.59 
 
 		 165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  37.86 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3496  biotin synthase  37.5 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.296204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  34.92 
 
 		 170 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  36.36 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  35.61 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  34.93 
 
 		 183 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  35.29 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  36.81 
 
 		 205 aa  104  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  37.8 
 
 		 166 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  37.5 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  32.85 
 
 		 167 aa  102  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  32.12 
 
 		 171 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  36.36 
 
 		 165 aa  102  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  36.36 
 
 		 165 aa  102  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  32.12 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  32.12 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  37.6 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  32.12 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  32.12 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  37.6 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  37.6 
 
 		 163 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  40 
 
 		 183 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  32.12 
 
 		 178 aa  100  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  32.12 
 
 		 171 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  32.12 
 
 		 178 aa  100  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  32.12 
 
 		 174 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  40.43 
 
 		 189 aa  100  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  32.12 
 
 		 175 aa  100  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  38.17 
 
 		 218 aa  100  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  31.69 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  31.39 
 
 		 175 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  31.39 
 
 		 175 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  31.39 
 
 		 175 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  31.39 
 
 		 175 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  31.39 
 
 		 175 aa  98.6  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  31.39 
 
 		 175 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  35.25 
 
 		 159 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  31.39 
 
 		 175 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  31.39 
 
 		 175 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0165  CheW protein  33.8 
 
 		 183 aa  99  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  43.75 
 
 		 174 aa  98.6  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  30.71 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  35.56 
 
 		 161 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  38.58 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  32.14 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  40.35 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  32.62 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.17 
 
 		 174 aa  95.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  39.47 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  35.71 
 
 		 164 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  35.71 
 
 		 164 aa  95.5  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  34.27 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 159 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  40.35 
 
 		 170 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  40.35 
 
 		 170 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  40.35 
 
 		 170 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  40.35 
 
 		 170 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  33.33 
 
 		 159 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  40.35 
 
 		 170 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  40.35 
 
 		 170 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  33.33 
 
 		 159 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>