More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1184 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  100 
 
 		 161 aa  316  7.999999999999999e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  68.79 
 
 		 159 aa  224  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  56.71 
 
 		 164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  56.71 
 
 		 164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  56.71 
 
 		 164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  56.71 
 
 		 164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  60.42 
 
 		 162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  56.71 
 
 		 164 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  56.1 
 
 		 164 aa  180  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  56.1 
 
 		 164 aa  180  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  56.1 
 
 		 164 aa  180  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  56.1 
 
 		 164 aa  180  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  56.71 
 
 		 164 aa  180  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  56.1 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  55.9 
 
 		 164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  63.83 
 
 		 164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  55.9 
 
 		 161 aa  177  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  56.44 
 
 		 163 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  56.67 
 
 		 162 aa  176  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  55.42 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  57.64 
 
 		 161 aa  175  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  55.21 
 
 		 163 aa  175  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  54.88 
 
 		 164 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  61.81 
 
 		 163 aa  175  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  53.66 
 
 		 174 aa  174  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  60.42 
 
 		 159 aa  174  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  53.66 
 
 		 164 aa  174  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  55 
 
 		 161 aa  174  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  59.72 
 
 		 164 aa  173  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  59.57 
 
 		 159 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  59.57 
 
 		 159 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  58.33 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  58.33 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  58.33 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  58.33 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  54.61 
 
 		 165 aa  169  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  54.97 
 
 		 164 aa  167  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  55.32 
 
 		 163 aa  163  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  61.65 
 
 		 159 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  60.9 
 
 		 159 aa  160  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  42.86 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  48.7 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  47.83 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  40.13 
 
 		 169 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  36.91 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  40.14 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  47.83 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  41.43 
 
 		 163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  37.5 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  37.75 
 
 		 163 aa  117  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  38.04 
 
 		 187 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  39.35 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  40.74 
 
 		 147 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  36.96 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  36.88 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  38.16 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  39.29 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  40.82 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  44.29 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  36.67 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  37.93 
 
 		 157 aa  113  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  37.42 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  37.67 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  37.67 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  38.1 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  38.52 
 
 		 163 aa  110  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  39.51 
 
 		 205 aa  110  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  40.6 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3228  putative CheW protein  51.64 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000337303  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.69 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  38.69 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  36 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  35 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  36.49 
 
 		 189 aa  108  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  34.19 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  39.13 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  36 
 
 		 162 aa  107  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  35.42 
 
 		 171 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  38.16 
 
 		 518 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  37.96 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  42.86 
 
 		 164 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  33.99 
 
 		 177 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  33.99 
 
 		 177 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  33.33 
 
 		 154 aa  107  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  33.99 
 
 		 171 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  36.05 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  34.69 
 
 		 174 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  33.99 
 
 		 171 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  34.07 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  31.79 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0724  CheW protein  47.52 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  32.3 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  34.72 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  33.09 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  36.96 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  41.13 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  37.76 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  33.33 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  33.33 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  32.87 
 
 		 165 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>