More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3205 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  100 
 
 		 162 aa  330  7.000000000000001e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  47.41 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  48.15 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  48.15 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  47.41 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  45.38 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  45.38 
 
 		 158 aa  134  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  43.28 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  41.55 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  43.28 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  46.38 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  42.03 
 
 		 155 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  43.08 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  43.17 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  41.96 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  41.3 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  41.01 
 
 		 158 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  44.53 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  41.43 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  44.12 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  43.36 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  38.22 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  39.35 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  36.49 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  37.86 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  30.14 
 
 		 167 aa  107  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  33.33 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  34 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  30.87 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  32.68 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  40.91 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.89 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  33.56 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  32.24 
 
 		 185 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  32.89 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0150  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.48 
 
 		 153 aa  101  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  32.89 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  34.48 
 
 		 169 aa  100  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  32.62 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  32.89 
 
 		 170 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  32 
 
 		 164 aa  100  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  33.75 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  30.92 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  33.1 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  30.92 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  34.29 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  31.43 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  30.82 
 
 		 185 aa  99.4  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  34.25 
 
 		 179 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  34.29 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  31.72 
 
 		 167 aa  99  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  31.69 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  31.76 
 
 		 171 aa  98.6  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.33 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  34.25 
 
 		 179 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  28.99 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  30.92 
 
 		 160 aa  98.2  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  30.26 
 
 		 194 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  30.26 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.33 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.99 
 
 		 164 aa  97.8  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  30.99 
 
 		 166 aa  97.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  32.62 
 
 		 163 aa  97.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  28.99 
 
 		 164 aa  97.8  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  28.99 
 
 		 164 aa  97.8  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  28.99 
 
 		 164 aa  97.8  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  32.89 
 
 		 165 aa  97.4  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.75 
 
 		 174 aa  97.1  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  30 
 
 		 163 aa  97.1  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  28.99 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  28.99 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  28.99 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  28.99 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  30 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  32.12 
 
 		 170 aa  95.9  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  32.52 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.99 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  29.33 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  29.33 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  27.54 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  33.57 
 
 		 179 aa  95.5  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  28.39 
 
 		 164 aa  94.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  32.62 
 
 		 169 aa  95.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  30 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  31.91 
 
 		 163 aa  94.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  27.78 
 
 		 161 aa  95.1  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  31.13 
 
 		 174 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  28.99 
 
 		 164 aa  94.7  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  35.21 
 
 		 165 aa  94.7  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  28.39 
 
 		 164 aa  94.7  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  29.45 
 
 		 178 aa  94.7  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  29.56 
 
 		 171 aa  94.4  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  29.73 
 
 		 174 aa  94.4  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  31.33 
 
 		 159 aa  94.4  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  30.43 
 
 		 164 aa  94.4  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  30.14 
 
 		 175 aa  94.4  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  31.43 
 
 		 162 aa  94.4  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  31.29 
 
 		 185 aa  94  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  27.78 
 
 		 164 aa  94  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  27.78 
 
 		 163 aa  94  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>