More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1795 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  100 
 
 		 152 aa  296  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  74.5 
 
 		 152 aa  224  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  74.5 
 
 		 152 aa  224  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  56.34 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  55.63 
 
 		 155 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  58.96 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  56.2 
 
 		 154 aa  169  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  56.03 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  58.09 
 
 		 161 aa  165  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  54 
 
 		 159 aa  163  6.9999999999999995e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  54.48 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  50 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  48.46 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  48.46 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  48.46 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  47.69 
 
 		 154 aa  143  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  47.79 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  50.36 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  45.07 
 
 		 158 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  46.1 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  45.07 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  46.56 
 
 		 159 aa  130  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  42.18 
 
 		 175 aa  127  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  41.96 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  44.44 
 
 		 157 aa  118  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  42.14 
 
 		 158 aa  116  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  38.41 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  38.64 
 
 		 174 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  36.91 
 
 		 177 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  36.91 
 
 		 177 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  36.91 
 
 		 171 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  36.91 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  45.19 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  37.58 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  36.91 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  36.91 
 
 		 178 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 		 175 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 		 175 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 		 175 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 		 175 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 		 175 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 		 175 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 		 175 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  37.24 
 
 		 178 aa  110  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  39.57 
 
 		 169 aa  110  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  37.24 
 
 		 171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  39.29 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  36.91 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  37.24 
 
 		 175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  39.57 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  38.57 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  39.57 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  39.71 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  36.36 
 
 		 174 aa  107  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  37.69 
 
 		 171 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  39.69 
 
 		 163 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  39.69 
 
 		 163 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  39.23 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  33.78 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  38.19 
 
 		 183 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  36.5 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.56 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  36.81 
 
 		 170 aa  103  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  35.86 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  38.17 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  34.23 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  37.96 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  35.86 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  37.31 
 
 		 185 aa  100  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0165  CheW protein  40.74 
 
 		 183 aa  100  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  31.88 
 
 		 170 aa  100  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  31.88 
 
 		 170 aa  100  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  38.73 
 
 		 163 aa  100  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  33.33 
 
 		 159 aa  100  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  35.46 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  35.46 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  34.01 
 
 		 167 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  34.01 
 
 		 167 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  34.01 
 
 		 167 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  32.62 
 
 		 170 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  32.62 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  36.73 
 
 		 174 aa  99.4  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  32.62 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  34.01 
 
 		 167 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  34.01 
 
 		 167 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  32.62 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  37.41 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  33.1 
 
 		 163 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  33.56 
 
 		 166 aa  98.2  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3496  biotin synthase  35.57 
 
 		 179 aa  97.4  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.296204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  30.71 
 
 		 160 aa  97.1  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  38.13 
 
 		 168 aa  97.1  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  38.69 
 
 		 158 aa  97.1  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  31.16 
 
 		 170 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  33.33 
 
 		 167 aa  97.1  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  36.57 
 
 		 187 aa  96.7  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  33.33 
 
 		 165 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  33.33 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  37.93 
 
 		 170 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  36.8 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>