More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4154 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  100 
 
 
147 aa  290  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  56.2 
 
 
158 aa  148  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  57.98 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  57.98 
 
 
158 aa  144  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  57.98 
 
 
158 aa  144  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  50.36 
 
 
167 aa  142  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  51.8 
 
 
163 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  51.03 
 
 
518 aa  140  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  47.79 
 
 
183 aa  140  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  49.28 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  59.66 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  49.28 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  50 
 
 
162 aa  138  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  56.67 
 
 
164 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  50 
 
 
168 aa  137  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  49.28 
 
 
164 aa  137  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  53.62 
 
 
165 aa  137  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  49.26 
 
 
163 aa  135  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  48.91 
 
 
154 aa  133  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  45.32 
 
 
167 aa  133  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  56.3 
 
 
166 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  43.7 
 
 
163 aa  130  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  48.55 
 
 
173 aa  130  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  51.15 
 
 
163 aa  130  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  46.67 
 
 
168 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  42.54 
 
 
170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  48.15 
 
 
164 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  42.22 
 
 
163 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  42.22 
 
 
163 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  46.32 
 
 
165 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  48.2 
 
 
169 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  46.32 
 
 
164 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  42.86 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  41.01 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  42.54 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  43.26 
 
 
164 aa  123  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  44.93 
 
 
165 aa  123  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  44.93 
 
 
165 aa  123  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  43.26 
 
 
164 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  43.26 
 
 
164 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  43.07 
 
 
164 aa  121  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  45.71 
 
 
166 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  45.52 
 
 
161 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  43.07 
 
 
164 aa  121  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  43.07 
 
 
164 aa  121  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  43.07 
 
 
164 aa  121  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  40.56 
 
 
163 aa  121  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  43.07 
 
 
164 aa  121  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  40.74 
 
 
166 aa  120  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  39.13 
 
 
165 aa  120  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  40.15 
 
 
158 aa  120  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  43.8 
 
 
163 aa  120  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  44.2 
 
 
159 aa  120  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  43.07 
 
 
164 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  43.07 
 
 
164 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  43.07 
 
 
164 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  43.07 
 
 
164 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  39.86 
 
 
165 aa  120  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  42.75 
 
 
218 aa  120  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  39.86 
 
 
165 aa  120  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  40.58 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  40.58 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  39.71 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  40.58 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  39.71 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  40.58 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  40.58 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  39.13 
 
 
174 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  40 
 
 
177 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  40 
 
 
177 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  42.66 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  39.13 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  39.13 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  39.13 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  42.66 
 
 
164 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  43.07 
 
 
161 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  45.26 
 
 
159 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  40 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  39.13 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  39.13 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  39.13 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  39.13 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  43.8 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  42.34 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  39.13 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  42.66 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  40.3 
 
 
160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  40 
 
 
162 aa  118  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  40 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  42.45 
 
 
150 aa  117  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  42.34 
 
 
163 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  45.83 
 
 
154 aa  118  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  50.78 
 
 
159 aa  118  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  39.26 
 
 
171 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  43.36 
 
 
174 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  45.26 
 
 
161 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  38.69 
 
 
174 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  44.44 
 
 
148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  45.52 
 
 
159 aa  117  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  45.52 
 
 
161 aa  117  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>