More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03247 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  100 
 
 		 515 aa  1037    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  36 
 
 		 533 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  35.43 
 
 		 568 aa  274  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  33.27 
 
 		 520 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  28.95 
 
 		 531 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  31.67 
 
 		 518 aa  210  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  28.17 
 
 		 478 aa  189  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  28.16 
 
 		 479 aa  138  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  23.77 
 
 		 528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  40.29 
 
 		 165 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0761  CheW protein  23.49 
 
 		 475 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.951826  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  36.99 
 
 		 159 aa  97.4  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  40.77 
 
 		 164 aa  97.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  38.1 
 
 		 148 aa  97.4  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  36.22 
 
 		 158 aa  97.4  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  41.94 
 
 		 136 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  35.48 
 
 		 161 aa  95.1  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  43.64 
 
 		 169 aa  94  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  35.37 
 
 		 161 aa  94  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  34.57 
 
 		 164 aa  93.2  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  34.69 
 
 		 164 aa  92.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  38.35 
 
 		 161 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  38.57 
 
 		 171 aa  92.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  41.96 
 
 		 166 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  34.97 
 
 		 163 aa  92  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  36.49 
 
 		 162 aa  92.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  39.52 
 
 		 139 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  33.13 
 
 		 205 aa  91.7  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.29 
 
 		 164 aa  90.9  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  34.39 
 
 		 163 aa  91.3  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  35.29 
 
 		 164 aa  90.9  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  35.29 
 
 		 164 aa  90.9  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  35.29 
 
 		 164 aa  90.9  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  37.59 
 
 		 159 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  33.12 
 
 		 163 aa  90.9  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.59 
 
 		 159 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  37.59 
 
 		 159 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  37.59 
 
 		 159 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  37.59 
 
 		 159 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  37.59 
 
 		 159 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  37.41 
 
 		 159 aa  90.1  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.95 
 
 		 164 aa  90.1  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  37.59 
 
 		 159 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  37.59 
 
 		 159 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  35.29 
 
 		 164 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  30.57 
 
 		 157 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  35.29 
 
 		 164 aa  89.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  38.84 
 
 		 158 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  35.29 
 
 		 164 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  35.29 
 
 		 164 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  35.42 
 
 		 218 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  35.29 
 
 		 164 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  39.53 
 
 		 147 aa  89.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  38.02 
 
 		 158 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  36.84 
 
 		 159 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  38.02 
 
 		 158 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  39.09 
 
 		 154 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  33.56 
 
 		 168 aa  88.2  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.68 
 
 		 164 aa  88.2  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  35.53 
 
 		 155 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.54 
 
 		 174 aa  88.2  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  32.32 
 
 		 159 aa  88.6  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  37.1 
 
 		 164 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  34.59 
 
 		 164 aa  88.2  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  34.56 
 
 		 162 aa  87.8  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  34.87 
 
 		 164 aa  87.8  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  39.67 
 
 		 164 aa  87  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  34.87 
 
 		 155 aa  87  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  35.86 
 
 		 158 aa  86.7  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  35.33 
 
 		 161 aa  86.7  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  35.54 
 
 		 168 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  34.18 
 
 		 164 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  34.18 
 
 		 164 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  34.9 
 
 		 167 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  42.06 
 
 		 165 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  37.19 
 
 		 165 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  37.19 
 
 		 165 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  34.85 
 
 		 169 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  30.12 
 
 		 164 aa  85.5  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  34.15 
 
 		 161 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  32.68 
 
 		 167 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  35.77 
 
 		 163 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  36.18 
 
 		 163 aa  84.7  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  38.68 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  34.87 
 
 		 163 aa  84  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  33.33 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  36.25 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  37.61 
 
 		 150 aa  83.2  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  35.29 
 
 		 161 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  32.65 
 
 		 158 aa  83.2  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.29 
 
 		 165 aa  83.2  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  30.63 
 
 		 167 aa  82  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  34.43 
 
 		 148 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  30.72 
 
 		 163 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  37.39 
 
 		 164 aa  81.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  30.72 
 
 		 163 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  29.9 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  30.54 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  30.54 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  32.14 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>