More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0332 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  100 
 
 
165 aa  327  6e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  81.21 
 
 
165 aa  268  2.9999999999999997e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  70.18 
 
 
173 aa  231  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  70.18 
 
 
173 aa  231  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  70.18 
 
 
173 aa  231  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  69.77 
 
 
172 aa  228  2e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0206  CheW domain protein  70.3 
 
 
164 aa  216  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00161643  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  56.97 
 
 
163 aa  191  4e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  44.44 
 
 
158 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  43.94 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  45.53 
 
 
158 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  44.44 
 
 
158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  32.67 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  34.53 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  42.4 
 
 
165 aa  107  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  36.55 
 
 
164 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.93 
 
 
164 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  33.55 
 
 
164 aa  104  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  36.96 
 
 
159 aa  104  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  38.3 
 
 
165 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  38.21 
 
 
164 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  39.55 
 
 
160 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  38.52 
 
 
147 aa  102  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  35.46 
 
 
164 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  35.46 
 
 
164 aa  102  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.89 
 
 
174 aa  101  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  38.3 
 
 
165 aa  100  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  38.3 
 
 
165 aa  100  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  38.81 
 
 
163 aa  100  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  36.71 
 
 
170 aa  100  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  34.69 
 
 
165 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  34.69 
 
 
165 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  30.97 
 
 
164 aa  99.8  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  35.33 
 
 
168 aa  99.4  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  37.31 
 
 
238 aa  99.8  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  40.15 
 
 
159 aa  99  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  36.17 
 
 
168 aa  99.8  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  34.04 
 
 
164 aa  98.6  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  37.76 
 
 
164 aa  98.2  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  36.81 
 
 
262 aa  97.8  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.8 
 
 
164 aa  97.8  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  28.95 
 
 
164 aa  97.4  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.41 
 
 
164 aa  97.1  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  39.5 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  32.41 
 
 
161 aa  96.3  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  29.41 
 
 
164 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  29.41 
 
 
164 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  29.41 
 
 
164 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  29.41 
 
 
164 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  29.41 
 
 
164 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  29.41 
 
 
164 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  29.41 
 
 
164 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  34.25 
 
 
159 aa  95.5  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  31.65 
 
 
163 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  36.57 
 
 
146 aa  95.5  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  35.04 
 
 
183 aa  95.1  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  29.41 
 
 
164 aa  94.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  37.16 
 
 
164 aa  94.7  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  35.37 
 
 
165 aa  94.7  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  29.8 
 
 
164 aa  94.7  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  29.14 
 
 
159 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  37.78 
 
 
169 aa  94.4  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  29.14 
 
 
159 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  38.41 
 
 
148 aa  94.4  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.3 
 
 
159 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  29.3 
 
 
159 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0742  CheW protein  39.55 
 
 
275 aa  94  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  29.3 
 
 
159 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  29.3 
 
 
159 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0757  CheW protein  39.55 
 
 
276 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  33.09 
 
 
161 aa  93.6  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  33.78 
 
 
189 aa  93.6  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  35 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  37.5 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  33.1 
 
 
167 aa  91.3  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  34.51 
 
 
518 aa  90.9  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  29.86 
 
 
163 aa  91.3  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  30.22 
 
 
162 aa  90.9  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  28.67 
 
 
161 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  27.97 
 
 
159 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  31.65 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  33.82 
 
 
163 aa  90.5  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0317  purine-binding chemotaxis protein  36.76 
 
 
176 aa  90.5  1e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.76 
 
 
170 aa  89.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  28.57 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  31.39 
 
 
165 aa  89  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  28.57 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  29.71 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  34.11 
 
 
169 aa  89  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  32.47 
 
 
163 aa  88.2  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  31.76 
 
 
171 aa  88.2  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  37.23 
 
 
154 aa  88.6  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  34.31 
 
 
150 aa  88.2  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  32.47 
 
 
163 aa  87.8  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  33.08 
 
 
161 aa  87.8  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  33.79 
 
 
149 aa  87.8  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  32.47 
 
 
163 aa  87.8  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  35.66 
 
 
158 aa  87.4  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  33.12 
 
 
187 aa  87.4  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  30.2 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>