More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1773 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  100 
 
 
161 aa  315  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  47.22 
 
 
162 aa  141  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  53.23 
 
 
164 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  42.76 
 
 
183 aa  136  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  48.15 
 
 
163 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  48.61 
 
 
158 aa  134  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  45.21 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  44.05 
 
 
189 aa  128  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  43.06 
 
 
159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  50.83 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  50 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  50 
 
 
158 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  43.45 
 
 
167 aa  124  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  43.8 
 
 
163 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  45.52 
 
 
147 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  40.71 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  45.64 
 
 
166 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  37.58 
 
 
173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  39.19 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  41.43 
 
 
164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  37.67 
 
 
159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  37.67 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  38.36 
 
 
163 aa  117  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  37.67 
 
 
164 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  38.36 
 
 
159 aa  117  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.67 
 
 
164 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  37.67 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  37.67 
 
 
164 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  37.67 
 
 
164 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  37.67 
 
 
164 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.67 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  38.36 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  37.67 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  38.36 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  36.99 
 
 
164 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  46.27 
 
 
159 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  38.57 
 
 
164 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  36.99 
 
 
164 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  36.99 
 
 
164 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  36.99 
 
 
164 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  36.91 
 
 
168 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.57 
 
 
164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.99 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  36.99 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  36.99 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  36.99 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  40.74 
 
 
159 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  38.36 
 
 
162 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  38.46 
 
 
161 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  40 
 
 
159 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  37.93 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  38.19 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  38.57 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  39.29 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  39.86 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  37.67 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  36.3 
 
 
161 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  36.55 
 
 
165 aa  112  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  36.99 
 
 
164 aa  111  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  35.81 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  36.99 
 
 
164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  35.81 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.99 
 
 
174 aa  111  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  50 
 
 
165 aa  111  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  42.03 
 
 
518 aa  111  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  38.1 
 
 
150 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  41.01 
 
 
157 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  42.95 
 
 
159 aa  110  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  39.29 
 
 
165 aa  110  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  38.46 
 
 
164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  38.36 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  37.78 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  38.57 
 
 
165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  37.93 
 
 
520 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  37.24 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  38.57 
 
 
165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  37.41 
 
 
150 aa  107  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  37.68 
 
 
145 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  38.89 
 
 
154 aa  107  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  40 
 
 
160 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  36.57 
 
 
170 aa  106  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  37.76 
 
 
161 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  45.83 
 
 
166 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  39.55 
 
 
158 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  38.41 
 
 
165 aa  104  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  38.81 
 
 
148 aa  104  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  38.93 
 
 
163 aa  104  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  37.75 
 
 
160 aa  104  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  35.86 
 
 
162 aa  103  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  38.52 
 
 
159 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  46.79 
 
 
169 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  38 
 
 
163 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  36.76 
 
 
165 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  40 
 
 
166 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  35.62 
 
 
167 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  35.86 
 
 
163 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  40 
 
 
158 aa  101  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  34.87 
 
 
185 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  36.55 
 
 
163 aa  100  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  35.86 
 
 
166 aa  100  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>