More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1450 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  100 
 
 		 518 aa  1026    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  35.98 
 
 		 533 aa  281  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  33.66 
 
 		 568 aa  262  8.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  31.94 
 
 		 515 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  29.96 
 
 		 520 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  29.86 
 
 		 531 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  26.82 
 
 		 478 aa  195  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  28.07 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  51.03 
 
 		 147 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  47.62 
 
 		 167 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  46.67 
 
 		 163 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  47.52 
 
 		 162 aa  130  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  52.5 
 
 		 158 aa  130  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  54.17 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  51.67 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  47.79 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  51.61 
 
 		 164 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  51.67 
 
 		 158 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  42.68 
 
 		 183 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  41.67 
 
 		 218 aa  128  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  44.14 
 
 		 168 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  41.61 
 
 		 164 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  50 
 
 		 158 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  49.17 
 
 		 166 aa  124  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  40.41 
 
 		 161 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  37.16 
 
 		 168 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  42.76 
 
 		 159 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  37.67 
 
 		 163 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.86 
 
 		 164 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  42.96 
 
 		 165 aa  120  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  23.74 
 
 		 528 aa  120  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  37.01 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  38.36 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.36 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  36.99 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  38.36 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  38.36 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  38.36 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  37.67 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  37.67 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  37.67 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.67 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  35.9 
 
 		 162 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  36.3 
 
 		 164 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  36.99 
 
 		 164 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  40.82 
 
 		 165 aa  117  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  40.82 
 
 		 165 aa  117  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  43.97 
 
 		 159 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  36.99 
 
 		 164 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.3 
 
 		 164 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  36.99 
 
 		 164 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  36.99 
 
 		 164 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  36.3 
 
 		 164 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  36.3 
 
 		 164 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  36.3 
 
 		 164 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  36.99 
 
 		 164 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  44.85 
 
 		 148 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  36.3 
 
 		 164 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  35.62 
 
 		 164 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  38.36 
 
 		 164 aa  116  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  36.69 
 
 		 173 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  33.53 
 
 		 161 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  38.89 
 
 		 164 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  41.55 
 
 		 145 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  36.3 
 
 		 161 aa  115  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  36.3 
 
 		 164 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  36.3 
 
 		 159 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  41.01 
 
 		 159 aa  114  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  34.84 
 
 		 165 aa  114  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.3 
 
 		 174 aa  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  40 
 
 		 159 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  40.14 
 
 		 155 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  36.3 
 
 		 164 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  37.93 
 
 		 192 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  36.3 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  45.86 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  36.99 
 
 		 163 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  46.1 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  37.78 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  33.55 
 
 		 174 aa  111  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  42.03 
 
 		 161 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  38.85 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  38.85 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  35.76 
 
 		 185 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  36.73 
 
 		 167 aa  110  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  39.46 
 
 		 155 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  32.68 
 
 		 167 aa  110  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  34.9 
 
 		 169 aa  109  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  33.11 
 
 		 175 aa  109  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  36.55 
 
 		 163 aa  109  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  42.22 
 
 		 189 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  38.52 
 
 		 159 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  36.3 
 
 		 165 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  43.7 
 
 		 179 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  47.2 
 
 		 159 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  30.97 
 
 		 178 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  30.97 
 
 		 178 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  40.85 
 
 		 140 aa  108  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  40.29 
 
 		 154 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  37.84 
 
 		 163 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>