More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1014 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  100 
 
 		 520 aa  1050    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  40.4 
 
 		 533 aa  364  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  38.57 
 
 		 568 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  34.53 
 
 		 531 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  33.67 
 
 		 515 aa  274  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  31.75 
 
 		 518 aa  214  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  31.58 
 
 		 479 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  26.36 
 
 		 478 aa  163  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  43.31 
 
 		 164 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  44.22 
 
 		 164 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  41.33 
 
 		 162 aa  120  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  54.05 
 
 		 166 aa  118  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  41.45 
 
 		 183 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  47.69 
 
 		 164 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  43.26 
 
 		 168 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  25.1 
 
 		 528 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  46.1 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  49.14 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  39.19 
 
 		 164 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  39.73 
 
 		 167 aa  110  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  51.38 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  44.44 
 
 		 148 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  44.2 
 
 		 165 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  50.45 
 
 		 158 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  37.93 
 
 		 161 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  38.3 
 
 		 165 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0761  CheW protein  25.68 
 
 		 475 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.951826  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  43.26 
 
 		 165 aa  107  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  43.26 
 
 		 165 aa  107  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  39.46 
 
 		 164 aa  106  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  50.93 
 
 		 165 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  39.72 
 
 		 168 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  35.8 
 
 		 164 aa  104  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  47.66 
 
 		 163 aa  103  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  38 
 
 		 163 aa  103  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  35.62 
 
 		 161 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.91 
 
 		 164 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  35.62 
 
 		 163 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  37.5 
 
 		 163 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  36.91 
 
 		 164 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  36.91 
 
 		 164 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  36 
 
 		 159 aa  103  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  36.91 
 
 		 164 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  37.16 
 
 		 164 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  37.16 
 
 		 164 aa  101  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  37.16 
 
 		 164 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  37.16 
 
 		 164 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  37.16 
 
 		 164 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.8 
 
 		 164 aa  101  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  36.36 
 
 		 163 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  45.87 
 
 		 169 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  35.81 
 
 		 162 aa  100  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  40.88 
 
 		 147 aa  100  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  36.49 
 
 		 164 aa  100  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  35.17 
 
 		 159 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  36.55 
 
 		 161 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  35.42 
 
 		 159 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  38.52 
 
 		 154 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  35.42 
 
 		 159 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  44.63 
 
 		 157 aa  99  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  40.94 
 
 		 189 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.17 
 
 		 159 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  35.17 
 
 		 159 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  35.17 
 
 		 159 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  35.17 
 
 		 159 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  37.32 
 
 		 170 aa  97.4  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  42.37 
 
 		 136 aa  97.4  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  47.12 
 
 		 159 aa  97.1  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  34.48 
 
 		 163 aa  97.1  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  39.73 
 
 		 166 aa  96.7  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  34.72 
 
 		 161 aa  96.3  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  43.4 
 
 		 154 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  37.24 
 
 		 164 aa  95.9  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  36.3 
 
 		 170 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.18 
 
 		 174 aa  95.5  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  32.73 
 
 		 167 aa  94.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  34.39 
 
 		 166 aa  94.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  35.29 
 
 		 159 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  35.29 
 
 		 159 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  40.19 
 
 		 145 aa  94.7  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  36.03 
 
 		 141 aa  94.7  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  44.86 
 
 		 179 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  35.21 
 
 		 167 aa  94.4  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  94  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3975  CheW protein  36.76 
 
 		 141 aa  94  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000746819 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  33.33 
 
 		 164 aa  94  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  33.76 
 
 		 165 aa  93.6  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  36.49 
 
 		 162 aa  93.2  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  36.49 
 
 		 162 aa  93.2  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  35.17 
 
 		 171 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  33.76 
 
 		 165 aa  93.2  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  33.76 
 
 		 165 aa  93.2  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  35.17 
 
 		 174 aa  93.2  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  34.72 
 
 		 164 aa  93.2  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  34.04 
 
 		 150 aa  93.2  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  34.42 
 
 		 166 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  33.33 
 
 		 183 aa  92.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0757  CheW protein  44.14 
 
 		 276 aa  91.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202103 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  43.56 
 
 		 139 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  36.42 
 
 		 163 aa  91.3  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>