More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1634 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  100 
 
 		 170 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  91.18 
 
 		 169 aa  296  6e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  91.18 
 
 		 169 aa  296  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  47.1 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  50.74 
 
 		 171 aa  141  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  48.3 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  49.68 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  43.24 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  49.66 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  46 
 
 		 163 aa  131  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  49.33 
 
 		 166 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  43.66 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  43.57 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  43.57 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  39.73 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  38.51 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  39.31 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  36.65 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  40.91 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  36.25 
 
 		 170 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  36.65 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  43.71 
 
 		 205 aa  107  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  40.69 
 
 		 162 aa  107  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  40.43 
 
 		 218 aa  107  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  39.04 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  36.77 
 
 		 167 aa  107  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  36.08 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  39.29 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  39.29 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  40.28 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  40.28 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  37.34 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  35.62 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  38.36 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  36.08 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.62 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  38.36 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  40.71 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  39.29 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  38.36 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  40.71 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  36.08 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  37.34 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  43.88 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  35 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  41.79 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  38.71 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  39.29 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  40 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  40 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  38.36 
 
 		 165 aa  105  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  38.36 
 
 		 165 aa  105  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  40.71 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  40.71 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  39.58 
 
 		 184 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  40.71 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  40 
 
 		 171 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  40.71 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  40.71 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  35 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  40.71 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  40.71 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  37.01 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  38.22 
 
 		 175 aa  104  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  35.58 
 
 		 174 aa  104  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  40.71 
 
 		 175 aa  104  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  40.85 
 
 		 162 aa  104  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  39.29 
 
 		 163 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  39.29 
 
 		 163 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  39.04 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  35.25 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  42.03 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  38.57 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  35.19 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  42.75 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  37.86 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  37.86 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  37.86 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  37.86 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  37.86 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  37.86 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  37.86 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  37.86 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  39.6 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  36.62 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  37.86 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  37.86 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  37.86 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  37.24 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  37.86 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  37.86 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  38.62 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  37.84 
 
 		 179 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  39.31 
 
 		 162 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  37.68 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  37.86 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  39.31 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  38.57 
 
 		 166 aa  101  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  40.69 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  40 
 
 		 168 aa  100  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>