More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2363 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  100 
 
 
156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  74.5 
 
 
157 aa  219  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  55.77 
 
 
171 aa  172  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  54.48 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  53.9 
 
 
163 aa  157  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  51.06 
 
 
165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  55.38 
 
 
166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  49.68 
 
 
170 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  49.29 
 
 
163 aa  141  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  48.39 
 
 
169 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  48.39 
 
 
169 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  41.84 
 
 
160 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  40 
 
 
163 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  40 
 
 
163 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  40.29 
 
 
164 aa  121  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  40 
 
 
163 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  44.44 
 
 
169 aa  120  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.73 
 
 
164 aa  120  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  46.28 
 
 
164 aa  120  9e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  45.6 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  44.44 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  40.14 
 
 
174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  40.82 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  44.44 
 
 
158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  42.47 
 
 
158 aa  117  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  38.13 
 
 
157 aa  117  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  40.88 
 
 
163 aa  117  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  42.54 
 
 
163 aa  117  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  40.29 
 
 
178 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  45.65 
 
 
175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  39.46 
 
 
174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  40.29 
 
 
175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  44.37 
 
 
185 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  46.76 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  41.79 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  42.03 
 
 
145 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  37.78 
 
 
158 aa  114  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  41.13 
 
 
176 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  39.29 
 
 
174 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  40 
 
 
160 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  39.49 
 
 
179 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  37.01 
 
 
171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  41.96 
 
 
187 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.57 
 
 
164 aa  114  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  39.57 
 
 
175 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  37.25 
 
 
178 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  39.57 
 
 
175 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  39.57 
 
 
175 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  39.72 
 
 
156 aa  114  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  39.57 
 
 
175 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  39.57 
 
 
175 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  39.26 
 
 
170 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  39.57 
 
 
175 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  39.57 
 
 
175 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.57 
 
 
164 aa  114  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  39.26 
 
 
165 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  39.26 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  39.26 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  38.3 
 
 
175 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  40.56 
 
 
164 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  37.25 
 
 
178 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  37.86 
 
 
177 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  37.86 
 
 
177 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  37.86 
 
 
171 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  37.25 
 
 
170 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  39.86 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  37.86 
 
 
171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  38.52 
 
 
170 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  38.52 
 
 
170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  38.13 
 
 
163 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  37.86 
 
 
171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  38.52 
 
 
170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.29 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.52 
 
 
170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  38.73 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  41.46 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  39.26 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  43.7 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  38.89 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  38.52 
 
 
163 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  40.13 
 
 
179 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  38.41 
 
 
174 aa  111  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  38.52 
 
 
160 aa  110  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  34.78 
 
 
218 aa  110  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  40 
 
 
162 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  36.43 
 
 
165 aa  110  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  36.88 
 
 
184 aa  110  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  37.01 
 
 
161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  38.73 
 
 
167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  36.57 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  36.67 
 
 
166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  44.44 
 
 
194 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  44.44 
 
 
194 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  45.19 
 
 
194 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  36.3 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  42.54 
 
 
179 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  43.65 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  37.78 
 
 
167 aa  107  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  36.69 
 
 
161 aa  107  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  36.43 
 
 
165 aa  107  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>