More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1774 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  100 
 
 		 179 aa  356  9.999999999999999e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  73.6 
 
 		 181 aa  255  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  76.73 
 
 		 160 aa  247  6e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  75.14 
 
 		 184 aa  227  7e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  60.34 
 
 		 201 aa  201  5e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  60.8 
 
 		 177 aa  197  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  60.8 
 
 		 178 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  64.43 
 
 		 178 aa  190  8e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  62.43 
 
 		 187 aa  187  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  49.16 
 
 		 190 aa  155  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  49.34 
 
 		 169 aa  147  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  44.28 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  51.27 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  48.63 
 
 		 174 aa  144  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  36.36 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  36.88 
 
 		 907 aa  98.6  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  39.87 
 
 		 159 aa  95.1  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  38.46 
 
 		 779 aa  89  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  34.04 
 
 		 478 aa  84.3  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2885  CheW protein  32.68 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  28.99 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  35.85 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  40.82 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3975  CheW protein  39.8 
 
 		 141 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000746819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  40.82 
 
 		 165 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0689  CheW protein  34.53 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  33.11 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  37.74 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  36.36 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  38.1 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  38.1 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  38.1 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  38.1 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.75 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  33.75 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1944  CheW protein  33.81 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  37.84 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  37.27 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  39.29 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  37.9 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  30.19 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  33.11 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  30.18 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  33.11 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  40.59 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  30.19 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.21 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  35.57 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1642  CheW protein  44.74 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  30.41 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  36.61 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  36.45 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  31.87 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  32.43 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  35.25 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  40.4 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  31.75 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  39.42 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  40.4 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  31.48 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  31.06 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  34.11 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  33.78 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  37.9 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  32.67 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  38.83 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0165  CheW protein  34.84 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  33.08 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  33.11 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  31.95 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.86 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.86 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  39.42 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.43 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  31.95 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  31.95 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  37.5 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  31.95 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  29.14 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  30.81 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  27.1 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  40.38 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  31.95 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  31.95 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  31.95 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  30.81 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  32.43 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  32.43 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  40.38 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  30.14 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  32.31 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  30.81 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  32.43 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2883  CheW protein  33.33 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  36.46 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  38.54 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  39.42 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  39.58 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  33.33 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  31.76 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>