244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2885 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2885  CheW protein  100 
 
 
404 aa  782    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  36.13 
 
 
160 aa  92.8  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  34.81 
 
 
181 aa  90.9  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  36.42 
 
 
170 aa  87.4  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  32.03 
 
 
201 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  31.52 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  33.55 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  30.77 
 
 
177 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  33.33 
 
 
907 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  32.45 
 
 
184 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  32.67 
 
 
174 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  32.45 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3152  CheW protein  35.61 
 
 
273 aa  77  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.168421  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  32.45 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1944  CheW protein  32.85 
 
 
425 aa  75.5  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0689  CheW protein  30.67 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  30.57 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  28.39 
 
 
189 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  32.62 
 
 
141 aa  70.5  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  27.4 
 
 
164 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  34.91 
 
 
179 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  34.67 
 
 
159 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.59 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0961  CheW protein  37.04 
 
 
268 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  30.87 
 
 
190 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  29.68 
 
 
779 aa  63.9  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  26.03 
 
 
165 aa  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0944  CheW protein  31.21 
 
 
141 aa  63.9  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  26.03 
 
 
165 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  28.3 
 
 
169 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  34.26 
 
 
154 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  33.65 
 
 
169 aa  62.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  29.93 
 
 
146 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2883  CheW protein  29.79 
 
 
177 aa  60.5  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325772  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.56 
 
 
174 aa  58.9  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  25.81 
 
 
170 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  23.81 
 
 
161 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  27.74 
 
 
159 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  24.49 
 
 
168 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1642  CheW protein  31.9 
 
 
124 aa  57.8  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116806  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  32.73 
 
 
148 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  25.17 
 
 
164 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2261  CheW protein  31.37 
 
 
161 aa  57.4  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00686219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  29.2 
 
 
160 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  28.44 
 
 
164 aa  56.6  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  29.17 
 
 
136 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  29.6 
 
 
163 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  28.44 
 
 
164 aa  56.6  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  25.85 
 
 
165 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  25.85 
 
 
165 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  26.67 
 
 
185 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  27.97 
 
 
147 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  28.49 
 
 
183 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  28.3 
 
 
165 aa  56.2  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  27.97 
 
 
147 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  29.36 
 
 
164 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  26.24 
 
 
139 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  26.67 
 
 
185 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  25.19 
 
 
173 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  31.25 
 
 
205 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  33.33 
 
 
185 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  31.87 
 
 
169 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  25 
 
 
164 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  27.78 
 
 
218 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  35.53 
 
 
200 aa  54.3  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  24.49 
 
 
164 aa  53.9  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  25.2 
 
 
159 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  28.38 
 
 
194 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  28.38 
 
 
194 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.32 
 
 
164 aa  53.5  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  24.32 
 
 
164 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  24.32 
 
 
164 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  24.32 
 
 
164 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  31.73 
 
 
187 aa  53.5  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  28.3 
 
 
163 aa  53.5  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  24.16 
 
 
167 aa  53.1  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  24.32 
 
 
164 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  28.97 
 
 
167 aa  53.1  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  25.17 
 
 
161 aa  53.1  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  26.17 
 
 
518 aa  53.1  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  23.97 
 
 
163 aa  53.1  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.32 
 
 
164 aa  53.1  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  24.32 
 
 
164 aa  53.1  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  27.52 
 
 
164 aa  53.1  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  24.32 
 
 
164 aa  53.1  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  24.32 
 
 
164 aa  53.1  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  24.32 
 
 
164 aa  53.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1154  putative CheW protein  30 
 
 
216 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.239991  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.92 
 
 
159 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  33.33 
 
 
159 aa  53.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  25.2 
 
 
159 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  26.92 
 
 
159 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  26.92 
 
 
159 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  25.17 
 
 
163 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  26.92 
 
 
159 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  28.08 
 
 
181 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  27.71 
 
 
181 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  24.49 
 
 
164 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  26.92 
 
 
159 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  27.15 
 
 
205 aa  52.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>