More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0689 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0689  CheW protein  100 
 
 		 333 aa  643    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1944  CheW protein  55.11 
 
 		 425 aa  183  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  47.01 
 
 		 141 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0944  CheW protein  48.84 
 
 		 141 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2261  CheW protein  43.07 
 
 		 161 aa  115  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00686219 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2883  CheW protein  42.64 
 
 		 177 aa  93.6  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325772  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  35.19 
 
 		 170 aa  85.1  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  37.78 
 
 		 184 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  34.97 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  32.43 
 
 		 164 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  38.74 
 
 		 159 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  34.27 
 
 		 181 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  38.79 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 164 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2885  CheW protein  29.69 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  30.41 
 
 		 183 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  35.51 
 
 		 168 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  33.33 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  34.03 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  33.33 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  42.16 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  33.33 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  39.62 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  33.57 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  33.57 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  33.1 
 
 		 179 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  37.93 
 
 		 159 aa  74.3  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  32.68 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  32.87 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  39.81 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  34.67 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  33.09 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  29.73 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  32 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  31.21 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  30.53 
 
 		 148 aa  72  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  31.91 
 
 		 170 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  31.91 
 
 		 170 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  31.91 
 
 		 170 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  32.14 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  32.24 
 
 		 174 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  35.78 
 
 		 174 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  30.65 
 
 		 165 aa  70.9  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  35.85 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  34.43 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  32.85 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  32.81 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  34.38 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  36.07 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  34.55 
 
 		 164 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  33.09 
 
 		 183 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  33.87 
 
 		 158 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  31.39 
 
 		 163 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  29.22 
 
 		 157 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  28.1 
 
 		 165 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  32.8 
 
 		 164 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  28.1 
 
 		 165 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  32.14 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.88 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  36.54 
 
 		 171 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  38.46 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  33.33 
 
 		 163 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  32.85 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  31.5 
 
 		 159 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  33.99 
 
 		 533 aa  67  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  35.96 
 
 		 169 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  31.25 
 
 		 161 aa  67  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  28.77 
 
 		 466 aa  66.6  0.0000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  35.25 
 
 		 190 aa  67  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  32.14 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  31.85 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  32.33 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  31.5 
 
 		 159 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  31.5 
 
 		 159 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  32.26 
 
 		 158 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  30.37 
 
 		 185 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  29.25 
 
 		 161 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  32.14 
 
 		 174 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  32.64 
 
 		 145 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  29.92 
 
 		 163 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  34.95 
 
 		 175 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  31.47 
 
 		 169 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  28.95 
 
 		 183 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  36.54 
 
 		 189 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  30 
 
 		 163 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  28.48 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  32.03 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  27.15 
 
 		 187 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  32.43 
 
 		 163 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  32.28 
 
 		 163 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.5 
 
 		 164 aa  65.1  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  30.99 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  35.4 
 
 		 163 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  30.26 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  33.33 
 
 		 158 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  29.08 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  34.95 
 
 		 167 aa  64.3  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  34.62 
 
 		 146 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  33.59 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  34.65 
 
 		 146 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>