More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0991 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  100 
 
 
183 aa  369  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  42.07 
 
 
200 aa  134  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  42.68 
 
 
199 aa  135  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  41.24 
 
 
205 aa  125  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  35.56 
 
 
325 aa  121  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  38.86 
 
 
181 aa  117  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  39.29 
 
 
189 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  37.64 
 
 
344 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  35.58 
 
 
200 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3202  CheW protein  35.09 
 
 
182 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.525075 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  36.96 
 
 
212 aa  88.6  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  32.26 
 
 
183 aa  84.7  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  36.23 
 
 
212 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  33.33 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  41.11 
 
 
212 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  34.17 
 
 
168 aa  77  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  29.91 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  33.86 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  32.35 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  31.36 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0793  CheW protein  29.82 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0767  CheW protein  30.07 
 
 
365 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0742  CheW protein  34.65 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.54 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0757  CheW protein  30.92 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  31.54 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  31.54 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  31.62 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.28 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  32.56 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  30.97 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  33.91 
 
 
163 aa  72  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  31.3 
 
 
166 aa  72  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  32.79 
 
 
169 aa  72  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  25.95 
 
 
170 aa  72  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  32.03 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  30.25 
 
 
907 aa  71.2  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  31.25 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2307  CheW protein  32.2 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  33.04 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  28.21 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  31.25 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  29.05 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  34.65 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  28.21 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  28.12 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  31.69 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  32.39 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  32.48 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  30.53 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  33.33 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  30.09 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  30.53 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  30.08 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  28.91 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  36.15 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  29.17 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  31.85 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  30.83 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1000  putative CheW protein  36.42 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  32.8 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  29.37 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  29.23 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  32.2 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  31.71 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  27.13 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  30.83 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  31.62 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0468  putative CheW protein  34.51 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0754564  normal  0.870958 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  32.28 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  31.45 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  32.8 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  36.15 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  26.03 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  33.33 
 
 
262 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  31.3 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  32.2 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  32.28 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  30.08 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  29.92 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  32.54 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  31.5 
 
 
160 aa  67  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  28.79 
 
 
163 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  29.92 
 
 
160 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  31.09 
 
 
154 aa  67  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  35.38 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  32.28 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  29.27 
 
 
163 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  30.47 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  29.13 
 
 
164 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  32 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  29.57 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  29.03 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  30.08 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  29.03 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  29.57 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  29.57 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  29.57 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  27.45 
 
 
162 aa  67  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  29.57 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>