More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2307 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2307  CheW protein  100 
 
 		 164 aa  330  5e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2218  chemotaxis protein CheW  81.17 
 
 		 158 aa  234  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  60.39 
 
 		 160 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  48.45 
 
 		 170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  48.45 
 
 		 170 aa  161  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  45.71 
 
 		 183 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  43.71 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  42.76 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2120  CheW protein  48.59 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  44.37 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  41.38 
 
 		 158 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  42.07 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  44.35 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  35.14 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  39.71 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  35.14 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  47.5 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  36.48 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  44.26 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  46.67 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  37.5 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  36.36 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  36.36 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  46.67 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  47.11 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  41.79 
 
 		 148 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  41.8 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  39.46 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  37.32 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  35.62 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.6 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  42.75 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  35.92 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  41.1 
 
 		 169 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  35.86 
 
 		 165 aa  113  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  37.06 
 
 		 192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  44.16 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  35.21 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  35.21 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  38.57 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  35.21 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  38.57 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  35.21 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  35.21 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  35.21 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  41.04 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  35.21 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  35.21 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  39.73 
 
 		 262 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  39.29 
 
 		 165 aa  111  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  36.91 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  36.17 
 
 		 164 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  36.17 
 
 		 170 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  36.17 
 
 		 164 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  35.42 
 
 		 218 aa  110  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  35.81 
 
 		 162 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  35.71 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  37.5 
 
 		 164 aa  110  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  37.86 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  36.55 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  42.86 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  35.07 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  33.57 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  39.42 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  33.57 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  41.61 
 
 		 139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  34.51 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  34.51 
 
 		 167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  33.57 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  35.07 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  33.57 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  33.57 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  35.51 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  33.79 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  35.33 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  34.48 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  35.46 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  32.86 
 
 		 171 aa  107  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  35.46 
 
 		 170 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  33.8 
 
 		 167 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  34.07 
 
 		 167 aa  107  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  33.8 
 
 		 167 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  33.8 
 
 		 167 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  40.32 
 
 		 166 aa  107  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  32.86 
 
 		 174 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  32.17 
 
 		 174 aa  107  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  33.8 
 
 		 167 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  33.8 
 
 		 167 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  35.46 
 
 		 170 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  35.66 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  33.57 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  35.92 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  33.33 
 
 		 174 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  35.92 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  33.57 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  30.87 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  33.57 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  32.43 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  33.57 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  36.76 
 
 		 253 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>