More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2120 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2120  CheW protein  100 
 
 		 161 aa  322  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  45 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  45.32 
 
 		 170 aa  127  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  45.32 
 
 		 170 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2307  CheW protein  50 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2218  chemotaxis protein CheW  50.35 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  30.52 
 
 		 168 aa  98.6  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  31.82 
 
 		 162 aa  94  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  34.04 
 
 		 167 aa  93.6  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  29.49 
 
 		 183 aa  93.6  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  33.33 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  31.08 
 
 		 167 aa  90.5  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  36.24 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  29.3 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  32.12 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5006  CheW protein  36.15 
 
 		 147 aa  89  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  31.39 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  37.3 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  30.66 
 
 		 163 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  38.02 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  31.47 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  38.02 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  31.47 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  29.17 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  31.11 
 
 		 148 aa  84.3  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  32.12 
 
 		 518 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  30.88 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  30.49 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  29.71 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  32.2 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  30.99 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  34.56 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.05 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  29.23 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  31.36 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  26.17 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  34.13 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  33.05 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  33.06 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  29.32 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  35.11 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  28.87 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  28.17 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  31.69 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  31.85 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  30.77 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  31.58 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  34.62 
 
 		 144 aa  77  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  28.17 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  32.17 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0822  putative CheW protein  29.37 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  33.58 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  26.53 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  29.66 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  33.85 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  31.11 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  31.11 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  31.65 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  30 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  27.66 
 
 		 301 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  30.22 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  27.46 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  27.46 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  29.5 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  29.63 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  28.99 
 
 		 444 aa  74.3  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  30.2 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  31.85 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  26.62 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  28.68 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  28.17 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  32.14 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  28.77 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  30.07 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  30.77 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  28.36 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  29.32 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  28.77 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  29.41 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  29.41 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  29.93 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  29.17 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  30.2 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  29.71 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  29.37 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  30.56 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  27.14 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  25.55 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1818  CheW protein  30.6 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1873  CheW protein  30.6 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  28.87 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  28.86 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  31.78 
 
 		 311 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  27.21 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  31.78 
 
 		 308 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  31.54 
 
 		 308 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  25.35 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  31.78 
 
 		 311 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3975  CheW protein  27.86 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000746819 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0315  putative CheW protein  35.19 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0805582  normal  0.229425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>