More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0320 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  100 
 
 
160 aa  316  7.999999999999999e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  41.43 
 
 
167 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  42 
 
 
166 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  40.82 
 
 
156 aa  121  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  41.73 
 
 
169 aa  120  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  42.45 
 
 
171 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  38.22 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  42.47 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  41.33 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  41.84 
 
 
165 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  41.84 
 
 
165 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  41.43 
 
 
174 aa  118  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  42.14 
 
 
218 aa  118  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  36.99 
 
 
160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  40.79 
 
 
167 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  40.79 
 
 
167 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  40.79 
 
 
167 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  40.79 
 
 
167 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  40.79 
 
 
167 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  40.79 
 
 
167 aa  117  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  40.71 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  39.46 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  39.33 
 
 
174 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  39.33 
 
 
174 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  40.4 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  39.46 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  39.29 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  39.29 
 
 
165 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  38.51 
 
 
162 aa  115  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  40 
 
 
165 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  42.45 
 
 
183 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  38.51 
 
 
162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  38.51 
 
 
163 aa  114  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  40.29 
 
 
162 aa  114  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  42.22 
 
 
158 aa  114  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  41.18 
 
 
187 aa  114  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  39.01 
 
 
163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  39.29 
 
 
165 aa  113  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  39.74 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  39.74 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  40 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  39.74 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  39.74 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  39.74 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  39.74 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  39.74 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  39.74 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  36.49 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  40.44 
 
 
166 aa  111  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  37.59 
 
 
162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  37.59 
 
 
162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  37.86 
 
 
177 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  37.86 
 
 
171 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  37.86 
 
 
177 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  37.86 
 
 
174 aa  110  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  37.86 
 
 
171 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  37.86 
 
 
171 aa  110  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  36.88 
 
 
164 aa  110  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  37.84 
 
 
165 aa  110  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  35.62 
 
 
166 aa  110  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  37.86 
 
 
178 aa  110  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  37.86 
 
 
175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  37.86 
 
 
175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  36.6 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  37.86 
 
 
175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  37.86 
 
 
175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  37.86 
 
 
175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  37.86 
 
 
175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  37.86 
 
 
175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  36.69 
 
 
174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  32.69 
 
 
174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  37.86 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  37.86 
 
 
175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  37.14 
 
 
171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  36.24 
 
 
175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  34.01 
 
 
159 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  34.01 
 
 
159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.26 
 
 
164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.71 
 
 
164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  39.87 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  36.3 
 
 
167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  34.03 
 
 
164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  34.75 
 
 
164 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  35.46 
 
 
170 aa  107  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  40.76 
 
 
185 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  38.46 
 
 
164 aa  106  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  34.01 
 
 
161 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  34.27 
 
 
163 aa  106  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  36.17 
 
 
164 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  39.16 
 
 
158 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  34.97 
 
 
164 aa  106  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  38.65 
 
 
183 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  37.67 
 
 
163 aa  106  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  37.93 
 
 
169 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  35.86 
 
 
164 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  35.86 
 
 
164 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  37.5 
 
 
162 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 
159 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  33.33 
 
 
159 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  33.33 
 
 
159 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>