More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1492 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  100 
 
 		 444 aa  912    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  32.09 
 
 		 466 aa  176  6e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  44.53 
 
 		 170 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  39.07 
 
 		 183 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  36.6 
 
 		 167 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  33.77 
 
 		 162 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  35.62 
 
 		 160 aa  104  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  32.64 
 
 		 165 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  32.64 
 
 		 165 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  35.71 
 
 		 145 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  34.97 
 
 		 157 aa  97.4  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  36.11 
 
 		 168 aa  97.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  34.25 
 
 		 163 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  34.97 
 
 		 165 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  32.64 
 
 		 161 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  32.41 
 
 		 167 aa  95.5  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  36.69 
 
 		 158 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  35.06 
 
 		 174 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  33.8 
 
 		 165 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  33.57 
 
 		 156 aa  94.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  31.65 
 
 		 168 aa  94.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  34.51 
 
 		 163 aa  94.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  32.86 
 
 		 159 aa  94  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  34.42 
 
 		 174 aa  93.2  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  32.87 
 
 		 147 aa  92.8  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  35.97 
 
 		 163 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  36.17 
 
 		 166 aa  92.8  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  33.57 
 
 		 164 aa  92.8  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  35.42 
 
 		 163 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  32.43 
 
 		 173 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  33.57 
 
 		 165 aa  92.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  33.57 
 
 		 165 aa  92.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  35.29 
 
 		 163 aa  91.3  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  35.83 
 
 		 158 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  35.83 
 
 		 158 aa  90.9  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  35.92 
 
 		 178 aa  90.5  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  35.92 
 
 		 178 aa  90.1  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 164 aa  90.1  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  36.67 
 
 		 165 aa  89.7  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  36.17 
 
 		 160 aa  89.7  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.17 
 
 		 164 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0257  putative purine-binding chemotaxis protein  38.51 
 
 		 161 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  34.56 
 
 		 163 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  31.47 
 
 		 164 aa  89.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  33.33 
 
 		 166 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  34.93 
 
 		 164 aa  89.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  31.33 
 
 		 159 aa  89.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  34.59 
 
 		 154 aa  89.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  33.54 
 
 		 189 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  34.56 
 
 		 163 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.17 
 
 		 164 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  31.33 
 
 		 218 aa  89  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  34.17 
 
 		 158 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  33.33 
 
 		 177 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  33.33 
 
 		 177 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  35.66 
 
 		 179 aa  88.6  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  35.92 
 
 		 174 aa  88.2  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  33.33 
 
 		 171 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  34.04 
 
 		 175 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  34.04 
 
 		 175 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  34.04 
 
 		 175 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  34.04 
 
 		 175 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  32.86 
 
 		 174 aa  88.2  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  34.04 
 
 		 175 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  34.04 
 
 		 175 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  34.04 
 
 		 175 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  33.33 
 
 		 171 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02230  putative purine-binding chemotaxis protein  37.84 
 
 		 161 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  37.76 
 
 		 170 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  37.76 
 
 		 170 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  37.76 
 
 		 158 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  37.76 
 
 		 170 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  37.76 
 
 		 158 aa  87.4  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  34.04 
 
 		 175 aa  87.4  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  37.76 
 
 		 170 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  33.33 
 
 		 171 aa  87.8  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  37.76 
 
 		 170 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  37.76 
 
 		 170 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  33.33 
 
 		 171 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2307  CheW protein  37.32 
 
 		 164 aa  87.4  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  32.61 
 
 		 178 aa  86.7  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  30.56 
 
 		 165 aa  86.7  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  31.29 
 
 		 168 aa  86.3  9e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.16 
 
 		 164 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  31.51 
 
 		 163 aa  86.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  33.09 
 
 		 162 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  33.09 
 
 		 162 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  34.31 
 
 		 175 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  32.34 
 
 		 171 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  31.29 
 
 		 159 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  30.41 
 
 		 164 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0757  CheW protein  33.33 
 
 		 276 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202103 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  31.25 
 
 		 162 aa  85.5  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  31.51 
 
 		 159 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  31.65 
 
 		 169 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  31.43 
 
 		 157 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  27.78 
 
 		 154 aa  84.7  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  34.75 
 
 		 205 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  31.51 
 
 		 159 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  33.33 
 
 		 163 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>