More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3297 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  100 
 
 		 308 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  97.73 
 
 		 308 aa  613  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  91.5 
 
 		 311 aa  579  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  90.2 
 
 		 311 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  89.87 
 
 		 311 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  90.2 
 
 		 311 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  89.87 
 
 		 311 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  83.88 
 
 		 310 aa  534  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  65.58 
 
 		 311 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  59.74 
 
 		 314 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  59.74 
 
 		 314 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  58.97 
 
 		 314 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  59.29 
 
 		 314 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  58.33 
 
 		 314 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  58.33 
 
 		 314 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  58.33 
 
 		 314 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  60.71 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  59.22 
 
 		 314 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  58.01 
 
 		 314 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  58.01 
 
 		 314 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  57.79 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  57.51 
 
 		 313 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  58.01 
 
 		 313 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  56.41 
 
 		 312 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  57.69 
 
 		 313 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  58.79 
 
 		 313 aa  363  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  58.39 
 
 		 317 aa  360  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  54.87 
 
 		 314 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  59.74 
 
 		 314 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  53.9 
 
 		 319 aa  352  4e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  53.97 
 
 		 309 aa  337  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  55.59 
 
 		 310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  53.95 
 
 		 310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  55.59 
 
 		 310 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  53.29 
 
 		 308 aa  332  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  53.29 
 
 		 308 aa  332  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  51.64 
 
 		 306 aa  332  6e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  52.3 
 
 		 306 aa  331  8e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  51.97 
 
 		 306 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  51.97 
 
 		 306 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  51.97 
 
 		 306 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  51.97 
 
 		 306 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  51.97 
 
 		 306 aa  330  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  51.64 
 
 		 306 aa  330  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  51.97 
 
 		 306 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  55.08 
 
 		 309 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  55.08 
 
 		 309 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  53.07 
 
 		 309 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  51.97 
 
 		 306 aa  329  4e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  54.75 
 
 		 309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  52.3 
 
 		 316 aa  327  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  55.05 
 
 		 310 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  51.32 
 
 		 306 aa  325  5e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  51.64 
 
 		 307 aa  325  5e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  51.32 
 
 		 306 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  51.32 
 
 		 306 aa  324  9e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  51.32 
 
 		 306 aa  322  3e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  51.99 
 
 		 306 aa  321  8e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  49.36 
 
 		 308 aa  319  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  49.68 
 
 		 308 aa  318  6e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  50.33 
 
 		 306 aa  317  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  51.15 
 
 		 309 aa  316  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  51.32 
 
 		 306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  49.84 
 
 		 312 aa  309  4e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  49.03 
 
 		 308 aa  308  8e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  49.84 
 
 		 311 aa  305  6e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  49.51 
 
 		 310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  51.32 
 
 		 309 aa  299  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  48.21 
 
 		 313 aa  290  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  46.82 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  48.18 
 
 		 309 aa  278  6e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  48.05 
 
 		 314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  47.91 
 
 		 314 aa  272  5.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  47.91 
 
 		 314 aa  272  5.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  47.04 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02930  chemotaxis protein  49.18 
 
 		 248 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.464973  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1561  response regulator receiver modulated CheW protein  38.43 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0294399  hitchhiker  0.00399966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2816  putative CheW protein  38.43 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2796  putative CheW protein  38.43 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  37.72 
 
 		 314 aa  206  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2936  putative CheW protein  38.08 
 
 		 298 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  37.99 
 
 		 319 aa  205  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  37.72 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  37.01 
 
 		 299 aa  203  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2201  chemotaxis protein CheV  39.57 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  37.96 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  36.65 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  35.94 
 
 		 308 aa  199  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2470  response regulator receiver modulated CheW protein  35.81 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  35.5 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  39.31 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0802  chemotaxis protein CheV  37.02 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0826  putative CheW protein  37.02 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449083  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  36.65 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  37.17 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  39.06 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  35.31 
 
 		 318 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0841  response regulator receiver modulated CheW protein  36.68 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1747  response regulator receiver modulated CheW protein  37.01 
 
 		 298 aa  195  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999043 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1437  response regulator receiver modulated CheW protein  36.3 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.080472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>