More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3603 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  100 
 
 		 139 aa  265  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5006  CheW protein  56.83 
 
 		 147 aa  151  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  54.74 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0315  putative CheW protein  57.38 
 
 		 146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0805582  normal  0.229425 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  50.36 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  49.62 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4225  CheW protein  48.53 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.497298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2003  CheW protein  48.92 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0578815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  45.59 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0521  CheW-like protein  40.77 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.77009 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1907  CheW domain protein  42.15 
 
 		 170 aa  95.9  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.96206  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3375  CheW protein  37.59 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0270944  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3802  CheW protein  38.35 
 
 		 164 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4246  CheW protein  38.35 
 
 		 164 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3677  CheW-like protein  36.57 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.340799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  32.85 
 
 		 165 aa  90.5  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  37.59 
 
 		 169 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  32.85 
 
 		 165 aa  90.5  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1873  CheW protein  35.82 
 
 		 166 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1818  CheW protein  35.82 
 
 		 166 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  31.34 
 
 		 170 aa  90.5  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  33.82 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3919  CheW protein  36.57 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4837  CheW protein  38.35 
 
 		 169 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6558  CheW protein  38.46 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  28.26 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  33.33 
 
 		 162 aa  87.4  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  35.04 
 
 		 161 aa  87  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  31.69 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  34.45 
 
 		 165 aa  86.3  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  32.58 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  31.62 
 
 		 168 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0525  CheW protein  35.82 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  29.32 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1713  CheW protein  37.23 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  30.15 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1810  CheW protein  37.96 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000143406  normal  0.276017 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1530  CheW domain-containing protein  37.96 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843757 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  33.33 
 
 		 171 aa  85.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  31.11 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  33.33 
 
 		 173 aa  84  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  32.12 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  30.15 
 
 		 165 aa  84  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  31.06 
 
 		 163 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2562  CheW protein  37.69 
 
 		 167 aa  83.6  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424252  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.15 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  35.94 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  27.74 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  36.17 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  34.09 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  33.83 
 
 		 518 aa  82  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  32.39 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  36.22 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  35.07 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  27.27 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  30.88 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  31.58 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  31.58 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.71 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  29.29 
 
 		 178 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  27.27 
 
 		 169 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  33.8 
 
 		 166 aa  80.1  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  31.39 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  34.29 
 
 		 192 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  28.99 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  34.07 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  31.62 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  32.58 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  31.43 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  34.75 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  30.99 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  32.58 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  29.5 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  32.09 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1154  putative CheW protein  36.03 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.239991  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  31.43 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  34.75 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  33.33 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  32.14 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  32.77 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  32.77 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  32.62 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  32.77 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0822  putative CheW protein  28.37 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  34.75 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  32.58 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  34.09 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  27.61 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  31.82 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0213  CheW protein  43.86 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178938  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  31.82 
 
 		 164 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  31.82 
 
 		 164 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  31.82 
 
 		 164 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4034  CheW protein  36.76 
 
 		 172 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488441  normal  0.598337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  31.82 
 
 		 164 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.35 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.35 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.82 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  30.15 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0751  CheW protein  32.37 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>