More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4225 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4225  CheW protein  100 
 
 		 151 aa  297  3e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.497298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  55.24 
 
 		 152 aa  169  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  53.33 
 
 		 140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5006  CheW protein  47.18 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0315  putative CheW protein  50.83 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0805582  normal  0.229425 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  48.53 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  42.54 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  42.22 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1907  CheW domain protein  43.88 
 
 		 170 aa  113  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.96206  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2003  CheW protein  40.83 
 
 		 140 aa  103  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0578815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2562  CheW protein  39.57 
 
 		 167 aa  100  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1818  CheW protein  34.31 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1873  CheW protein  34.31 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3677  CheW-like protein  34.56 
 
 		 156 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.340799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6558  CheW protein  35.29 
 
 		 157 aa  98.2  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0525  CheW protein  33.58 
 
 		 157 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0521  CheW-like protein  33.82 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.77009 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3375  CheW protein  32.45 
 
 		 156 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0270944  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4837  CheW protein  36.03 
 
 		 169 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  35.34 
 
 		 169 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  35.29 
 
 		 161 aa  94.7  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3919  CheW protein  33.82 
 
 		 167 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3802  CheW protein  31.97 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4246  CheW protein  31.97 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1713  CheW protein  30.28 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  31.97 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1810  CheW protein  30.99 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000143406  normal  0.276017 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1530  CheW domain-containing protein  30.99 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4034  CheW protein  34.72 
 
 		 172 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488441  normal  0.598337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  36.69 
 
 		 165 aa  86.7  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0213  CheW protein  45.79 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178938  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  31.39 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  33.33 
 
 		 170 aa  83.6  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  33.09 
 
 		 163 aa  83.6  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  33.56 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  32.09 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  33.33 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  31.11 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  34.01 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  34.04 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  34.03 
 
 		 518 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  32.35 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  31.11 
 
 		 161 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0822  putative CheW protein  36.5 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  31.11 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.11 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  32.84 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  32.19 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  31.11 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  31.11 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  31.11 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  31.11 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  31.11 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  31.11 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  32.61 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  31.11 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  31.11 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  31.11 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.11 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  31.11 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  30.37 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  32.09 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  29.93 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.09 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  32.09 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  32.09 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  31.85 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  32.09 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  32.09 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  31.11 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  33.08 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  32.09 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  28.08 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  35.56 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  32.09 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  31.11 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  29.2 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  28.37 
 
 		 218 aa  77  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  30.22 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  32.61 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  32.12 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  31.62 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  31.62 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  31.39 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  31.85 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  33.09 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  33.06 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  29.25 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  30.37 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  34.35 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  31.88 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  28.99 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  36.97 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  30.37 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  31.39 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.6 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  30.37 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  31.85 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  30.88 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>