More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1525 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  100 
 
 		 152 aa  305  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4225  CheW protein  55.24 
 
 		 151 aa  169  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.497298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  58.21 
 
 		 140 aa  154  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5006  CheW protein  54.01 
 
 		 147 aa  143  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  51.08 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  49.62 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0315  putative CheW protein  54.92 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0805582  normal  0.229425 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  46.72 
 
 		 139 aa  130  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2003  CheW protein  43.44 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0578815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1907  CheW domain protein  39.44 
 
 		 170 aa  103  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.96206  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0521  CheW-like protein  40.15 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.77009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3677  CheW-like protein  38.19 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.340799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  42.22 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  41.18 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3919  CheW protein  38.19 
 
 		 167 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1873  CheW protein  37.5 
 
 		 166 aa  97.1  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1818  CheW protein  37.5 
 
 		 166 aa  97.1  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  40.34 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  40.34 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  40.34 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  38.52 
 
 		 163 aa  94.4  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  40.16 
 
 		 164 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  36.62 
 
 		 161 aa  94.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.06 
 
 		 164 aa  93.6  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2562  CheW protein  39.26 
 
 		 167 aa  93.6  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424252  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  38.52 
 
 		 161 aa  94  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  37.06 
 
 		 164 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  37.06 
 
 		 164 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  37.06 
 
 		 164 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  38.52 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  38.81 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  38.81 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  37.31 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  34.09 
 
 		 170 aa  93.2  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  39.23 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  37.31 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  38.06 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.06 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  38.06 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  37.78 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  38.06 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  37.78 
 
 		 164 aa  91.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.57 
 
 		 174 aa  91.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  38.06 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  38.06 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  36.96 
 
 		 163 aa  91.3  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  31.25 
 
 		 218 aa  91.3  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4246  CheW protein  35.42 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3375  CheW protein  36.76 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0270944  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  36.69 
 
 		 159 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  37.04 
 
 		 164 aa  90.9  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  35.56 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  37.78 
 
 		 164 aa  91.3  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  37.78 
 
 		 164 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  37.78 
 
 		 164 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  37.78 
 
 		 164 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.78 
 
 		 164 aa  90.9  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3802  CheW protein  34.97 
 
 		 164 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  37.78 
 
 		 164 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  35.21 
 
 		 162 aa  90.5  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  37.78 
 
 		 173 aa  90.5  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  34.93 
 
 		 169 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  34.07 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  36.3 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  41.18 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  34.51 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  33.57 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0525  CheW protein  36.43 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  30.13 
 
 		 180 aa  88.6  3e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  37.31 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  36.3 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  36.62 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  31.11 
 
 		 165 aa  87.8  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  35.21 
 
 		 164 aa  87.8  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6558  CheW protein  36.17 
 
 		 157 aa  87.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4837  CheW protein  35 
 
 		 169 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  34.33 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  36.3 
 
 		 159 aa  87.4  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  34.35 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  35.62 
 
 		 165 aa  86.3  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  34.35 
 
 		 168 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  35.21 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1530  CheW domain-containing protein  34.25 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1713  CheW protein  33.56 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1810  CheW protein  34.25 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000143406  normal  0.276017 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  31.39 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  30.99 
 
 		 165 aa  85.5  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  35.66 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  34.64 
 
 		 189 aa  84.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  29.37 
 
 		 183 aa  84.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  35.04 
 
 		 163 aa  84  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4034  CheW protein  36.42 
 
 		 172 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488441  normal  0.598337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  33.55 
 
 		 161 aa  83.6  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  31.82 
 
 		 177 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  31.82 
 
 		 171 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  31.82 
 
 		 177 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  34.03 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  32.81 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  31.11 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  31.82 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>