More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0525 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0525  CheW protein  100 
 
 
157 aa  306  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6558  CheW protein  93.92 
 
 
157 aa  277  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3802  CheW protein  81.82 
 
 
164 aa  237  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4246  CheW protein  81.38 
 
 
164 aa  237  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1873  CheW protein  77.85 
 
 
166 aa  236  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1818  CheW protein  77.85 
 
 
166 aa  236  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3919  CheW protein  77.18 
 
 
167 aa  236  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3677  CheW-like protein  75.84 
 
 
156 aa  231  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.340799  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3375  CheW protein  70.2 
 
 
156 aa  222  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0270944  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0521  CheW-like protein  69.54 
 
 
156 aa  208  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.77009 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4034  CheW protein  53.9 
 
 
172 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488441  normal  0.598337 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2562  CheW protein  52.59 
 
 
167 aa  145  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4837  CheW protein  52.48 
 
 
169 aa  142  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  52.9 
 
 
169 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1810  CheW protein  48.53 
 
 
159 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000143406  normal  0.276017 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1530  CheW domain-containing protein  48.53 
 
 
159 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0843757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1713  CheW protein  48.15 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  47.97 
 
 
161 aa  130  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4225  CheW protein  33.58 
 
 
151 aa  97.8  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.497298  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1907  CheW domain protein  39.1 
 
 
170 aa  96.7  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.96206  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  36.43 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5006  CheW protein  37.12 
 
 
147 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2003  CheW protein  38.97 
 
 
140 aa  87  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0578815  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  38.69 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  36.5 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  33.57 
 
 
162 aa  86.3  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  35.82 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  32.86 
 
 
163 aa  85.5  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  39.53 
 
 
164 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  31.25 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  33.33 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  31.51 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  31.16 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  30.99 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  37.21 
 
 
144 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  29.8 
 
 
163 aa  82  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  36.76 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  34.11 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  30.26 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.5 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  31.06 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  29.55 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  30.5 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  30.5 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  30.5 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  31.33 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  30.5 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  30.5 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  30.5 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  32.8 
 
 
163 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  30.5 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  30.99 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  29.79 
 
 
164 aa  79  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  29.79 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  32.09 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  30.94 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.94 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  29.79 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  27.52 
 
 
183 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  33.57 
 
 
518 aa  77.4  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0315  putative CheW protein  33.88 
 
 
146 aa  77  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0805582  normal  0.229425 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  31.34 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  30.5 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  31.25 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  30 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  28.28 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  30.22 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  29.85 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  29.85 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  28 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  33.82 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  30.43 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  31.34 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  30.43 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  29.85 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  26.57 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  29.85 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  29.85 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  34.56 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  28.85 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  28.37 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.1 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  29.1 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  29.1 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  29.1 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  29.81 
 
 
184 aa  73.9  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  32.56 
 
 
520 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  27.78 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  29.73 
 
 
146 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  30 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  24.49 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  29.29 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  26.62 
 
 
165 aa  72  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  27.59 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  31.03 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  27.08 
 
 
164 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.76 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  32 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  28.06 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  31.03 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>