More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4034 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4034  CheW protein  100 
 
 		 172 aa  337  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488441  normal  0.598337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1530  CheW domain-containing protein  72.56 
 
 		 159 aa  223  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1810  CheW protein  72.56 
 
 		 159 aa  223  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000143406  normal  0.276017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1713  CheW protein  70.73 
 
 		 159 aa  218  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  55.15 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4837  CheW protein  53.76 
 
 		 169 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4246  CheW protein  52.7 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3802  CheW protein  53.47 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0525  CheW protein  53.9 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3375  CheW protein  49.66 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0270944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6558  CheW protein  52.29 
 
 		 157 aa  148  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1818  CheW protein  51.72 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1873  CheW protein  51.72 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3677  CheW-like protein  50.34 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.340799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3919  CheW protein  51.72 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  43.98 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0521  CheW-like protein  47.1 
 
 		 156 aa  135  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.77009 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2562  CheW protein  43.71 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424252  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1907  CheW domain protein  42.21 
 
 		 170 aa  101  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.96206  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  42.14 
 
 		 139 aa  95.1  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4225  CheW protein  34.72 
 
 		 151 aa  88.6  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.497298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5006  CheW protein  40 
 
 		 147 aa  85.1  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  40.74 
 
 		 144 aa  84.3  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2003  CheW protein  41.67 
 
 		 140 aa  83.6  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0578815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  36.42 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0315  putative CheW protein  38.84 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0805582  normal  0.229425 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  35.71 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  29.94 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  36.76 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  28.76 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  32.19 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  29.17 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  33.58 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0213  CheW protein  37.82 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178938  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  29.87 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  32.88 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0258  CheW protein  33.33 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000534163  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  31.58 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  34.29 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  31.43 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  31.43 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.71 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  31.21 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  29.19 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  33.33 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  29.22 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  30 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  29.5 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  28.3 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  31.91 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  32.09 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  30.26 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  29.33 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  31.39 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  34.26 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  30.5 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  30 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  30 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  30 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  30 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  30 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  31.72 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  32.88 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  30 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  30 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  30 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  30 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  30 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  30.5 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  27.86 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  29.79 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1071  CheW protein  31.25 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  26.97 
 
 		 218 aa  63.9  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  32.33 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  28.06 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  30 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  30.77 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  27.86 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  33.58 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  29.79 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.46 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.86 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  27.86 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  27.86 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  28.57 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  30.36 
 
 		 531 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  27.86 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  27.86 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  27.86 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  28.57 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  28.03 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  35.78 
 
 		 158 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  32.61 
 
 		 154 aa  62  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  28.78 
 
 		 192 aa  62  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  26.71 
 
 		 253 aa  62  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3204  CheW protein  32.89 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111901  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.54 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  34.86 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  35.19 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  29.14 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>