More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0659 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  100 
 
 
161 aa  317  3e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1530  CheW domain-containing protein  48.72 
 
 
159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0843757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1810  CheW protein  48.72 
 
 
159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000143406  normal  0.276017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  52.99 
 
 
169 aa  149  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1713  CheW protein  48.08 
 
 
159 aa  147  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4837  CheW protein  51.49 
 
 
169 aa  147  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3375  CheW protein  51.43 
 
 
156 aa  142  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0270944  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4034  CheW protein  43.98 
 
 
172 aa  140  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488441  normal  0.598337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3802  CheW protein  47.88 
 
 
164 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3919  CheW protein  46.54 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4246  CheW protein  48.39 
 
 
164 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1818  CheW protein  48.91 
 
 
166 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3677  CheW-like protein  48.25 
 
 
156 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.340799  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1873  CheW protein  48.91 
 
 
166 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0521  CheW-like protein  47.68 
 
 
156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.77009 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2562  CheW protein  43.71 
 
 
167 aa  130  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424252  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0525  CheW protein  47.97 
 
 
157 aa  130  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6558  CheW protein  46.84 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1907  CheW domain protein  44.97 
 
 
170 aa  121  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.96206  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  38.81 
 
 
159 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  37.76 
 
 
144 aa  98.2  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  39.26 
 
 
163 aa  96.3  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  39.42 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4225  CheW protein  35.29 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.497298  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  33.81 
 
 
163 aa  95.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 
163 aa  91.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2003  CheW protein  40 
 
 
140 aa  91.7  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0578815  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  33.11 
 
 
162 aa  91.7  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0315  putative CheW protein  38.33 
 
 
146 aa  91.3  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0805582  normal  0.229425 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  33.11 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5006  CheW protein  38.89 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  35.07 
 
 
162 aa  89.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.58 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  33.58 
 
 
162 aa  87.8  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  32.47 
 
 
160 aa  87.4  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  34.07 
 
 
159 aa  87.4  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  35.04 
 
 
139 aa  87  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  31.76 
 
 
165 aa  87  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  36.72 
 
 
149 aa  87  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  34.09 
 
 
161 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  35.25 
 
 
140 aa  87  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  35.21 
 
 
152 aa  86.3  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  32.84 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  31.85 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  31.85 
 
 
164 aa  84.7  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.84 
 
 
159 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.09 
 
 
164 aa  85.1  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  32.84 
 
 
159 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  32.84 
 
 
159 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  32.09 
 
 
164 aa  85.1  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  32.09 
 
 
164 aa  85.1  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  32.09 
 
 
164 aa  85.1  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  32.84 
 
 
159 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  32.84 
 
 
159 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  31.25 
 
 
163 aa  84.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  32.84 
 
 
159 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  31.85 
 
 
164 aa  84.3  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  32.47 
 
 
167 aa  84.3  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  32.88 
 
 
158 aa  84  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  32.09 
 
 
164 aa  84  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  31.85 
 
 
164 aa  84  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  31.85 
 
 
164 aa  84  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  31.85 
 
 
164 aa  84  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  31.85 
 
 
164 aa  84  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  32.09 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  35.77 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  32.09 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  32.09 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  39.82 
 
 
165 aa  82  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  35.11 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  36.97 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  32.09 
 
 
161 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  32.09 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  27.78 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  30.82 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  31.34 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  30.37 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  29.8 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  34.96 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.92 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  37.19 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.92 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  31.34 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  33.1 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  33.33 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  33.33 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  34.69 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.28 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.59 
 
 
164 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  32.64 
 
 
533 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  31.34 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  31.82 
 
 
253 aa  79  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  30 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  30 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  28.57 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  29.53 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  32.85 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  29.86 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  32.87 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  28.15 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>