More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1692 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  100 
 
 		 169 aa  337  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4837  CheW protein  89.35 
 
 		 169 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1713  CheW protein  61.31 
 
 		 159 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1530  CheW domain-containing protein  59.52 
 
 		 159 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1810  CheW protein  59.52 
 
 		 159 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000143406  normal  0.276017 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4034  CheW protein  55.15 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488441  normal  0.598337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4246  CheW protein  53.74 
 
 		 164 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3802  CheW protein  53.33 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3375  CheW protein  53.85 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0270944  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1873  CheW protein  51.02 
 
 		 166 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1818  CheW protein  51.02 
 
 		 166 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3677  CheW-like protein  51.02 
 
 		 156 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.340799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  52.99 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3919  CheW protein  51.7 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6558  CheW protein  51.02 
 
 		 157 aa  148  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0521  CheW-like protein  53.47 
 
 		 156 aa  147  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.77009 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2562  CheW protein  48.32 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424252  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0525  CheW protein  52.9 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1907  CheW domain protein  43.07 
 
 		 170 aa  104  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.96206  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  39.42 
 
 		 139 aa  94.7  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4225  CheW protein  35.34 
 
 		 151 aa  94.7  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.497298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  36.03 
 
 		 163 aa  94.7  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  38.97 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5006  CheW protein  40.94 
 
 		 147 aa  91.3  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  37.59 
 
 		 139 aa  90.9  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  34.93 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  36.3 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  38.52 
 
 		 140 aa  88.6  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0315  putative CheW protein  38.02 
 
 		 146 aa  87.4  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0805582  normal  0.229425 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  31.13 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  36.17 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  37.69 
 
 		 144 aa  86.3  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  34.01 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  34.51 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  36.91 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  37.14 
 
 		 161 aa  85.9  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  34.9 
 
 		 159 aa  84.7  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  34.9 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  31.52 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  30.5 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  32.17 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  34.59 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  32.35 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  37.74 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  35.86 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  33.79 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.54 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  31.88 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  33.58 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  31.21 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  35.03 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  30.83 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  35.96 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  32.21 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  32.21 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  36.79 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  30.87 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  34.56 
 
 		 533 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  33.12 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  33.76 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  36.43 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2003  CheW protein  38.69 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0578815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  36.6 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  36.3 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  29.93 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  33.96 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  33.08 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  30.41 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  34.78 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  30.41 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  33.11 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  32 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  32.33 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  32.65 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  29.55 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  32.61 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  30.08 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  30.6 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  34.53 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  34.53 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  29.86 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  28.06 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.65 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  29.73 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  34.06 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  33.33 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  33.33 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  33.33 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  32.5 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  32.03 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  32.43 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  30.38 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  30 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  32.61 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  33.33 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  30 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  32.48 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>