More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1713 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1713  CheW protein  100 
 
 		 159 aa  311  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1810  CheW protein  98.11 
 
 		 159 aa  306  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000143406  normal  0.276017 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1530  CheW domain-containing protein  98.11 
 
 		 159 aa  306  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4034  CheW protein  70.73 
 
 		 172 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488441  normal  0.598337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4837  CheW protein  63.19 
 
 		 169 aa  200  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  61.31 
 
 		 169 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3802  CheW protein  50.35 
 
 		 164 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4246  CheW protein  51.05 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  48.08 
 
 		 161 aa  147  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1873  CheW protein  47.33 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1818  CheW protein  47.33 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3919  CheW protein  48 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3677  CheW-like protein  47.33 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.340799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3375  CheW protein  51.85 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0270944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6558  CheW protein  49.26 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2562  CheW protein  45.58 
 
 		 167 aa  133  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424252  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0521  CheW-like protein  50.75 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.77009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0525  CheW protein  48.15 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1907  CheW domain protein  43.57 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.96206  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  43.8 
 
 		 139 aa  102  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0315  putative CheW protein  41.32 
 
 		 146 aa  96.3  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0805582  normal  0.229425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5006  CheW protein  40.16 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4225  CheW protein  30.28 
 
 		 151 aa  89  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.497298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  39.84 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  36.23 
 
 		 159 aa  87.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  36.76 
 
 		 140 aa  87.4  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  37.23 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  33.56 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2003  CheW protein  40.88 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0578815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  30.46 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  37.5 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  34.44 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  33.81 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  34.29 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  31.94 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  30.56 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  35.07 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  33.09 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  32.21 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  30.52 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  31.51 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  30.43 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  29.87 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  31.13 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  31.11 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  33.33 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  30.92 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0213  CheW protein  35.59 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178938  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  29.41 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  31.61 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  30.52 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  32.37 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.06 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  30.43 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  29.58 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  32.59 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  37.74 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  29.49 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  33.83 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  31.88 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.32 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  38.61 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  29.37 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.85 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  29.85 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  29.85 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  29.85 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  32.9 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  27.74 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  37.62 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  29.63 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  30.56 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  29.85 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  29.85 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  29.85 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  29.85 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  29.85 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  29.85 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0258  CheW protein  29.93 
 
 		 152 aa  67  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000534163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  33.33 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  36.63 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  36.04 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  34.03 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  28.26 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  28.1 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.85 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  30.99 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  31.43 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  25.71 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  34.21 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  33.1 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.08 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  29.08 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  32.17 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  30.77 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  27.95 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  33.65 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  31.13 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  30.61 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  27.27 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>