More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0751 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0751  CheW protein  100 
 
 		 169 aa  337  4e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  41.73 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  41.01 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  39.86 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  43.17 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  41.01 
 
 		 161 aa  111  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  39.86 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  40.71 
 
 		 164 aa  110  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  38.13 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  40.71 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.01 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  42.86 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  41.01 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  41.01 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  41.01 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  38.57 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  40 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  40 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  40 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  40 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  38.06 
 
 		 163 aa  107  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  40.58 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  37.8 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  37.8 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  40 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  37.8 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  37.8 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  42.45 
 
 		 159 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  39.29 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  40 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  40.88 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  38.85 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  38.82 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  37.16 
 
 		 165 aa  104  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  38.69 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  36.75 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.41 
 
 		 174 aa  99.4  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  39.13 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  39.13 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  36.96 
 
 		 164 aa  99  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0724  CheW protein  37.24 
 
 		 171 aa  97.1  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  40 
 
 		 163 aa  94.4  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  37.5 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  33.57 
 
 		 162 aa  87.8  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  31.65 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  34.81 
 
 		 157 aa  85.5  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  38.69 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  33.54 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  33.33 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  33.57 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  33.33 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  32.69 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  32.69 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  33.82 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  33.82 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  34.33 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  30.2 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  28.57 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  28.57 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  31.03 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.58 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.78 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  33.57 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  33.8 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  32.85 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.16 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  35.92 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  32.41 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  33.33 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  31.43 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  35.04 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.31 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  32.09 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.31 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  31.29 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  33.58 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  32.41 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  30.6 
 
 		 158 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  29.71 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  34.93 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  36.67 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  31.29 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  33.82 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  32.37 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  32.06 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  28.47 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  34.27 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  28.57 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  28.78 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  29.93 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  29.84 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  35.56 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  35.83 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  34.53 
 
 		 179 aa  73.9  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  30.88 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  35.04 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  30.29 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  28.47 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  31.62 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  30.83 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.666694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>