More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0767 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0767  CheW protein  100 
 
 
365 aa  719    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0793  CheW protein  95.89 
 
 
365 aa  662    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2361  CheW protein  27.35 
 
 
342 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  22.55 
 
 
515 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  33.55 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  27.97 
 
 
162 aa  80.5  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  31.94 
 
 
205 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  27.89 
 
 
165 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  28.22 
 
 
189 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  17.88 
 
 
518 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  33.82 
 
 
146 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  31.47 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  29.08 
 
 
161 aa  77  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  27.7 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.49 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  26.49 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  26.49 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  26.49 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  27.34 
 
 
164 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  27.66 
 
 
179 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  27.81 
 
 
162 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  27.34 
 
 
164 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  30.07 
 
 
183 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  27.27 
 
 
158 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  27.66 
 
 
164 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  26.24 
 
 
162 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  27.66 
 
 
163 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  27.27 
 
 
159 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  29.41 
 
 
159 aa  74.7  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  27.94 
 
 
158 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  29.5 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  27.34 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  31.88 
 
 
163 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  26.62 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  26.62 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  26.62 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  26.62 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.62 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  29.32 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  28.99 
 
 
175 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  22.08 
 
 
478 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  29.68 
 
 
164 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  27.21 
 
 
161 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  26.85 
 
 
161 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  25.9 
 
 
163 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  31.85 
 
 
146 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  32.06 
 
 
146 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  28.03 
 
 
163 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  28.19 
 
 
163 aa  72  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  31.11 
 
 
165 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  31.11 
 
 
165 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  28.95 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  32 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  32 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  27.45 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  28.87 
 
 
157 aa  70.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  27.06 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  27.45 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  22.87 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  26.06 
 
 
162 aa  70.5  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  30.71 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.68 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  30.82 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  19.45 
 
 
533 aa  70.1  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  25.68 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  25.68 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  30.15 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  25.68 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2706  CheW protein  27.78 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  26.21 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  25.85 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  26 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0090  CheW protein  26.67 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  26.16 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  29.93 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  28.47 
 
 
165 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  25.17 
 
 
159 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  27.34 
 
 
168 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  28.57 
 
 
170 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  28.57 
 
 
164 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  25.62 
 
 
167 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  25.85 
 
 
159 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  26.09 
 
 
156 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  25 
 
 
159 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  25 
 
 
159 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  26.09 
 
 
156 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  27.45 
 
 
160 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0329  CheW protein  26.85 
 
 
158 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  27.03 
 
 
194 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0196  response regulator receiver modulated CheW protein  25.31 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.031176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  25.85 
 
 
159 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  30.77 
 
 
163 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  24.34 
 
 
154 aa  67.8  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  27.54 
 
 
155 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  28.17 
 
 
159 aa  67  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  24.82 
 
 
164 aa  67  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  27.97 
 
 
147 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  26.09 
 
 
154 aa  67  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  28.86 
 
 
159 aa  67  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  27.33 
 
 
163 aa  67  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>