More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0329 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0329  CheW protein  100 
 
 		 158 aa  320  4e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2706  CheW protein  48.28 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2458  CheW protein  45.45 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211003  normal  0.0838028 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2188  CheW protein  41.5 
 
 		 153 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1325  CheW protein  39.33 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2031  CheW protein  40.14 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.505139  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  34.53 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  31.85 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  37.59 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  34.75 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  30.13 
 
 		 163 aa  84  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  34.75 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  33.81 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  32.87 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  33.8 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  31.16 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  34.75 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.56 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  34.69 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.75 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  34.04 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  33.56 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  33.56 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  33.56 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  34.04 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  34.04 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  33.58 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  34.06 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  33.55 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  34.04 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  34.04 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  34.04 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  34.04 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  34.04 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.79 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  32.58 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.47 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  31.47 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  31.47 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  31.47 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  33.08 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  33.33 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  33.1 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  31.76 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  29.71 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  29.71 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  32.87 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3257  CheW protein  35.17 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  29.71 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  30.43 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  31.25 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  31.25 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  31.54 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  30.72 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  26.9 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  29.71 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  32.17 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  36.64 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  29.71 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  29.71 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  31.11 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  29.86 
 
 		 189 aa  73.9  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.99 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  27.33 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  26.43 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  30.77 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  30.94 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  28.57 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  34.62 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2293  putative CheW protein  30.3 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  28.78 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  29.05 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  29.93 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  30.19 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  31.69 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0090  CheW protein  29.55 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  29.29 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  29.29 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  29.29 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  29.29 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  32.14 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  31.91 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  33.91 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  30.07 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  31.33 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  27.78 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  29.29 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  27.4 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  28.57 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  28.37 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  28.19 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  28.37 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  29.53 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  28.37 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  32.39 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  28.37 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  29.08 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  31.67 
 
 		 518 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  28.37 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  28.37 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>