More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2706 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2706  CheW protein  100 
 
 		 155 aa  308  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2458  CheW protein  54.48 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211003  normal  0.0838028 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0329  CheW protein  48.28 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2031  CheW protein  46.58 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.505139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2188  CheW protein  46.58 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1325  CheW protein  41.78 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  35.29 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  33.1 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  36.64 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  31.79 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  32.58 
 
 		 139 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  32.87 
 
 		 162 aa  87.8  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  32.24 
 
 		 160 aa  87  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  31.51 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  30.43 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  30.46 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  30.07 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  33.33 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  34.43 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  32.61 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  32.62 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  36.11 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  28.99 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.86 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  34.15 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0993  CheW protein  27.33 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165537  normal  0.34586 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  30 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  32.79 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  32.86 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  31.91 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  29.73 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  31.91 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2218  chemotaxis protein CheW  34.75 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.88 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  31.88 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  31.97 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  31.88 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  29.63 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  30.77 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  31.21 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.88 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.37 
 
 		 174 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  29.58 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  30.3 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  29.73 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  28.86 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  30.07 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  25.85 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  27.66 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  28.17 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2307  CheW protein  31.72 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  30.43 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.07 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  30.07 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  30.07 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  30.07 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  30.43 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  29.93 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  27.89 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  27.89 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  27.66 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  27.66 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  27.03 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  30.22 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  29.79 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  28.37 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0822  putative CheW protein  28.28 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  28.57 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  28.57 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  28.57 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  30.95 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2935  CheW protein  32.24 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  28.77 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  29.25 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  28.67 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  28.77 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  28.67 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  29.93 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  31.97 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  26.9 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  28.87 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  28.48 
 
 		 518 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  31.4 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  28.78 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  27.89 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  27.7 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  27.7 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2293  putative CheW protein  34.06 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  27.7 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  27.7 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  32.41 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  27.7 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>