More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1611 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  100 
 
 		 141 aa  278  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  44.44 
 
 		 145 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  44.12 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  42.22 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  43.8 
 
 		 163 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  40.15 
 
 		 183 aa  102  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  40.85 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  42.34 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  40.15 
 
 		 170 aa  100  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  39.55 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  41.18 
 
 		 136 aa  98.2  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  38.36 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  38.36 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  40.15 
 
 		 163 aa  97.8  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  42.31 
 
 		 163 aa  97.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  39.29 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  42.54 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  37.96 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  40.94 
 
 		 164 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  37.68 
 
 		 165 aa  95.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  43.07 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  44.63 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  38.35 
 
 		 168 aa  94.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  41.22 
 
 		 166 aa  94  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  37.86 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  43.8 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  44.63 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  36.23 
 
 		 159 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  36.5 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  36.5 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.29 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  37.23 
 
 		 173 aa  91.3  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  37.78 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  35.04 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  40.94 
 
 		 518 aa  90.9  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  36.5 
 
 		 163 aa  90.9  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  36.03 
 
 		 139 aa  90.1  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  36.17 
 
 		 218 aa  90.1  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  34.81 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  37.69 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  35.56 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.29 
 
 		 164 aa  88.6  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  35.56 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  37.31 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  35.29 
 
 		 164 aa  88.6  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  35.29 
 
 		 164 aa  88.6  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  37.5 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  35.29 
 
 		 164 aa  88.6  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  35.04 
 
 		 162 aa  88.6  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  35.29 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.77 
 
 		 159 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  34.33 
 
 		 163 aa  88.2  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  35.77 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  33.58 
 
 		 171 aa  88.2  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  35.77 
 
 		 159 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  35.29 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  35.77 
 
 		 159 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  33.58 
 
 		 177 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  35.77 
 
 		 159 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  34.56 
 
 		 164 aa  88.2  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  33.58 
 
 		 171 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  33.58 
 
 		 177 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  33.58 
 
 		 171 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  33.58 
 
 		 175 aa  87.8  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  37.59 
 
 		 168 aa  88.2  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  35.56 
 
 		 163 aa  87.8  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1667  putative CheW protein  36.29 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.33191  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  33.58 
 
 		 175 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  33.58 
 
 		 175 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  33.58 
 
 		 175 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  33.58 
 
 		 174 aa  87.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  38.76 
 
 		 160 aa  87.4  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  34.81 
 
 		 160 aa  87.8  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  36.57 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  33.58 
 
 		 175 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  33.58 
 
 		 175 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  33.58 
 
 		 175 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  33.58 
 
 		 175 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  33.58 
 
 		 163 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  33.58 
 
 		 163 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  35.29 
 
 		 164 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  35.29 
 
 		 164 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  35.29 
 
 		 164 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  37.8 
 
 		 155 aa  87  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  36.5 
 
 		 161 aa  87  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  35.29 
 
 		 164 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.56 
 
 		 164 aa  87.4  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  37.14 
 
 		 166 aa  87  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  36.57 
 
 		 155 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  35.97 
 
 		 165 aa  87  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  32.84 
 
 		 171 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  34.56 
 
 		 161 aa  86.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  34.81 
 
 		 164 aa  86.7  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  33.33 
 
 		 171 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.66 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  34.56 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  37.78 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  35.07 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  33.33 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  36.3 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>