More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2935 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2935  CheW protein  100 
 
 		 161 aa  320  5e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  42.19 
 
 		 145 aa  104  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  36.96 
 
 		 159 aa  97.1  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  37.88 
 
 		 163 aa  94.4  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  87.8  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  32.09 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  28.93 
 
 		 218 aa  86.3  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  29.41 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  31.85 
 
 		 160 aa  84  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  31.37 
 
 		 163 aa  84  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  34.07 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  31.16 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  28.47 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  36.52 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  31.88 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  31.88 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  31.88 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  31.88 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  31.88 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  31.03 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  31.03 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  31.03 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  31.03 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  31.03 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  31.03 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  31.03 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  31.03 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1667  putative CheW protein  39.42 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.33191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  31.78 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  32.61 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  29.71 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  29.71 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  28.48 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  29.71 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  28.99 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  28.99 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  34.07 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  28.29 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  28.48 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  29.71 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  29.71 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  29.71 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  29.71 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  29.71 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  29.71 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  33.62 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  29.71 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  29.71 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  29.71 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  29.71 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  31.36 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  31.62 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  28.67 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  32 
 
 		 518 aa  78.2  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  28.19 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  32.76 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  29.46 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  27.86 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  30.34 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  28.26 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  29.58 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  28.26 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  28.26 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  29.93 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  33.59 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  28.26 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  28.26 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  32.76 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  30.83 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  28.28 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  27.97 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  27.52 
 
 		 174 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  28.37 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  28.26 
 
 		 171 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  28.26 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  27.54 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  27.63 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  32.82 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  27.54 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  27.54 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  29.93 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  28.99 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  27.01 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  32.89 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  30.66 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  32.43 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  30.43 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  30.17 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  28.28 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  32.43 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  33.33 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  32.79 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  27.54 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  26.81 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  26.81 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  26.81 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  28.06 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  28.99 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  27.54 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>