153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0993 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0993  CheW protein  100 
 
 
167 aa  336  9.999999999999999e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165537  normal  0.34586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2706  CheW protein  27.33 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2458  CheW protein  26.35 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211003  normal  0.0838028 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0329  CheW protein  26.81 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1325  CheW protein  35.71 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2188  CheW protein  27.66 
 
 
153 aa  61.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2031  CheW protein  27.66 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.505139  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  29.55 
 
 
170 aa  58.5  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  26.8 
 
 
168 aa  57  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  30.12 
 
 
344 aa  57.4  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  35.56 
 
 
325 aa  57  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  25 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0388  CheW protein  26.9 
 
 
154 aa  56.6  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  25.62 
 
 
164 aa  54.3  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  30.23 
 
 
155 aa  54.3  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  22.67 
 
 
189 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  25.15 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2102  CheW protein  26.9 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0517911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3257  CheW protein  25.71 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447869 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  28.57 
 
 
319 aa  52.4  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  24.14 
 
 
161 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  28.36 
 
 
141 aa  51.2  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  24.03 
 
 
146 aa  51.6  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  24.64 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  27.27 
 
 
139 aa  50.8  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  27.78 
 
 
163 aa  50.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  25.17 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.73 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  25.68 
 
 
189 aa  48.9  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  25.81 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  30.39 
 
 
148 aa  49.3  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  25.24 
 
 
169 aa  48.9  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  25 
 
 
164 aa  48.5  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  25.35 
 
 
168 aa  48.5  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  25 
 
 
164 aa  48.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  23.01 
 
 
183 aa  47.4  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0793  CheW protein  26.26 
 
 
365 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  28.15 
 
 
136 aa  47.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0090  CheW protein  23.81 
 
 
176 aa  47.4  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  26.92 
 
 
158 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  22.45 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  27.34 
 
 
148 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  25 
 
 
139 aa  47  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.07 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.77 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  25.58 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0767  CheW protein  25.25 
 
 
365 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  29.41 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  29.13 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  22.78 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1071  CheW protein  24.71 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  26.61 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  26.32 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  21.24 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  25.23 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  25.58 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.14 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  25.17 
 
 
160 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  25.2 
 
 
159 aa  45.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.58 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  28.43 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.52 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  29.92 
 
 
166 aa  45.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  25.68 
 
 
152 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  25.52 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  25.52 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  21.77 
 
 
162 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  25.52 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  22.45 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  24.22 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3083  CheW protein  31.34 
 
 
154 aa  45.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245623  normal  0.222327 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  26.9 
 
 
163 aa  45.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0724  CheW protein  26.95 
 
 
171 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  25.58 
 
 
311 aa  45.1  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  22.38 
 
 
159 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.71 
 
 
164 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  25.71 
 
 
141 aa  45.1  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  24.58 
 
 
141 aa  45.1  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  25.52 
 
 
164 aa  45.1  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  23.72 
 
 
158 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  25.16 
 
 
161 aa  45.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  23.68 
 
 
174 aa  44.7  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  22.38 
 
 
159 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3202  CheW protein  26.53 
 
 
182 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.525075 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  24.46 
 
 
147 aa  44.7  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0761  CheW protein  26 
 
 
475 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.951826  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  21.94 
 
 
159 aa  44.3  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  24.11 
 
 
164 aa  44.3  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  25.34 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  25.52 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  21.85 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  23.65 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  21.26 
 
 
205 aa  43.9  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  25.52 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  25.52 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  24.11 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  25.52 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  22.67 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1713  CheW protein  25.49 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0927  CheW protein  27.78 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>