More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0735 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  100 
 
 
311 aa  629  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  71.1 
 
 
319 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  49.35 
 
 
322 aa  289  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  48.88 
 
 
322 aa  286  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0364  response regulator receiver modulated CheW protein  42.68 
 
 
317 aa  230  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  40.63 
 
 
320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3759  response regulator receiver modulated CheW protein  42.81 
 
 
323 aa  215  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00050568  normal  0.01011 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  40.89 
 
 
318 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1598  CheW protein  41.85 
 
 
317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  39.16 
 
 
313 aa  210  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  38.71 
 
 
316 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  38.71 
 
 
316 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1763  putative CheW protein  39.56 
 
 
320 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  38.82 
 
 
311 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0196  response regulator receiver modulated CheW protein  40.6 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.031176  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  37.5 
 
 
308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  38.39 
 
 
310 aa  199  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  38.59 
 
 
306 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  38.76 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  38.02 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1424  response regulator receiver modulated CheW protein  35.94 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  38.02 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  38.36 
 
 
311 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  38.44 
 
 
306 aa  197  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3018  CheW protein  36.36 
 
 
326 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2554  CheW protein  35.98 
 
 
334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.977607 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  37.17 
 
 
308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2543  CheW protein  35.98 
 
 
334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  39.02 
 
 
314 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  37.7 
 
 
311 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2658  CheW protein  35.98 
 
 
333 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2450  CheW protein  35.98 
 
 
333 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.979041  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  39.02 
 
 
314 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  37.94 
 
 
306 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  37.94 
 
 
306 aa  195  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1449  response regulator receiver modulated CheW protein  35.19 
 
 
321 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  37.62 
 
 
306 aa  195  9e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  36.98 
 
 
307 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1838  response regulator receiver modulated CheW protein  35.74 
 
 
321 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.230108  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  37.86 
 
 
316 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  37.62 
 
 
306 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2499  CheW protein  35.67 
 
 
334 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55114  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  38.44 
 
 
306 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  38.44 
 
 
306 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  38.44 
 
 
306 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  38.44 
 
 
306 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  34.95 
 
 
309 aa  192  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  37.75 
 
 
310 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2613  response regulator receiver modulated CheW protein  35.99 
 
 
325 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  33.23 
 
 
313 aa  189  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  38.46 
 
 
314 aa  189  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  37.42 
 
 
310 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2470  response regulator receiver modulated CheW protein  35.03 
 
 
324 aa  189  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  37.25 
 
 
309 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  37.54 
 
 
306 aa  188  9e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  34.38 
 
 
317 aa  188  9e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  37.33 
 
 
308 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  37.99 
 
 
310 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  34.21 
 
 
313 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  36.39 
 
 
306 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  36.84 
 
 
309 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  38.64 
 
 
324 aa  186  5e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  37.33 
 
 
310 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  37 
 
 
308 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  36.45 
 
 
306 aa  186  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  36.49 
 
 
311 aa  186  6e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  36.84 
 
 
309 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  36.84 
 
 
309 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  37.14 
 
 
306 aa  185  8e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  37.21 
 
 
313 aa  185  8e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  34.65 
 
 
313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  38.31 
 
 
306 aa  183  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  34.18 
 
 
338 aa  181  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  33.97 
 
 
319 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  37.99 
 
 
309 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  33.33 
 
 
312 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  36.89 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  34.43 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2819  putative CheW protein  34.8 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  34.3 
 
 
314 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  34.63 
 
 
313 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  34.47 
 
 
314 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  34.42 
 
 
314 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  33.98 
 
 
314 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1656  ATP synthase gamma chain (ATP synthase F1 sector gammasubunit)  34.74 
 
 
317 aa  177  1e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.184709  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  33.98 
 
 
314 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  33.98 
 
 
314 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  34.42 
 
 
314 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  33.76 
 
 
314 aa  178  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0204  CheW domain protein  34.47 
 
 
316 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000487468  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  34.42 
 
 
314 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  34.29 
 
 
306 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  34.41 
 
 
311 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  36.66 
 
 
312 aa  176  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  38.26 
 
 
311 aa  176  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  33.12 
 
 
317 aa  175  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  34.53 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  34.82 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1579  chemotaxis protein CheV  34.19 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.184882  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  33.55 
 
 
314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>