More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0496 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  100 
 
 		 344 aa  697    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  42.69 
 
 		 325 aa  235  7e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  37.64 
 
 		 183 aa  114  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  36.53 
 
 		 205 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  34.29 
 
 		 189 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  33.13 
 
 		 199 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  32.52 
 
 		 200 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  34.05 
 
 		 200 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  35 
 
 		 181 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  31.16 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  31.16 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  29.92 
 
 		 163 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  37.84 
 
 		 189 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  31.25 
 
 		 159 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  29.36 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  29.36 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  31.88 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  33.61 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.33 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  35.16 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  27.52 
 
 		 162 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  28.07 
 
 		 164 aa  72.4  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  27.03 
 
 		 161 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  33.6 
 
 		 160 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  30.08 
 
 		 170 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  34.4 
 
 		 181 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  36.67 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  36.29 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  27.2 
 
 		 907 aa  70.5  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  27.72 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0468  putative CheW protein  29.85 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0754564  normal  0.870958 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0793  CheW protein  26.67 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  28.07 
 
 		 163 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  30.39 
 
 		 162 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  32.04 
 
 		 218 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  36 
 
 		 174 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  28.33 
 
 		 164 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  35.35 
 
 		 147 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  29.2 
 
 		 164 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  34.55 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  40.74 
 
 		 185 aa  68.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  29.21 
 
 		 161 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  26.73 
 
 		 164 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1838  CheW protein  26.8 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00299326 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.3 
 
 		 165 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  37.33 
 
 		 159 aa  67  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  26.71 
 
 		 165 aa  67  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  27.66 
 
 		 150 aa  67  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  27.4 
 
 		 164 aa  67  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  30.3 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  25.86 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  28.71 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  35.11 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  31.18 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  26.76 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  31.18 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.69 
 
 		 164 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  25.71 
 
 		 164 aa  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3202  CheW protein  30.34 
 
 		 182 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.525075 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  28.04 
 
 		 165 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  25.49 
 
 		 159 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  31.58 
 
 		 184 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  25.49 
 
 		 159 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.49 
 
 		 159 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  25.49 
 
 		 159 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0767  CheW protein  25.19 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  25.49 
 
 		 159 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  24.91 
 
 		 518 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  25.49 
 
 		 159 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  25.49 
 
 		 159 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  24.76 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  30.36 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  29.46 
 
 		 154 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  24.76 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  25.71 
 
 		 163 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  26.95 
 
 		 150 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  24.76 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  24.76 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  25.17 
 
 		 162 aa  64.3  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  27.35 
 
 		 154 aa  64.3  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2380  CheW protein  26.88 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  23.53 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  24.43 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.76 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  23.53 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  23.26 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  24.76 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  24.76 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  24.76 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  23.53 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  29.29 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  30 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  30 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  30 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  28.57 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  33.33 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2883  CheW protein  36.56 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325772  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  32.58 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  36.75 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  27.78 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>