More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2399 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  100 
 
 		 190 aa  378  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  59.38 
 
 		 200 aa  228  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  53.4 
 
 		 189 aa  200  9e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  52.26 
 
 		 160 aa  157  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  49.11 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  47.67 
 
 		 177 aa  154  9e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  47.02 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  49.66 
 
 		 178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  53.29 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  51.02 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  45.62 
 
 		 174 aa  137  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  45.39 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  53.95 
 
 		 184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  47.49 
 
 		 179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  37.09 
 
 		 170 aa  92.4  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  39.2 
 
 		 165 aa  85.5  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  31.79 
 
 		 779 aa  82.4  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  32.91 
 
 		 159 aa  80.9  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  30.13 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  36.8 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.48 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  32.28 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  32.48 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  32.48 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  32.48 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  34.96 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  33.11 
 
 		 907 aa  79  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  31.1 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  39.6 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  35.06 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  36.05 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  32.48 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.48 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  31.85 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  31.85 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  31.85 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  31.85 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  30.77 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1642  CheW protein  40.16 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  34.15 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  32.48 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  34.96 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  40.57 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  31.72 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  32.59 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.59 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  32.59 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  32.59 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  34.92 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  34.25 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  34.4 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  29.94 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  35.54 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  29.56 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  32.19 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  42.71 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  34.4 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  33.33 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  33.33 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  36.89 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  31.39 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  32.12 
 
 		 168 aa  72  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  32.19 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  36.07 
 
 		 518 aa  71.6  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  31.51 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  40.2 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2261  CheW protein  30.71 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00686219 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  37 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  30.14 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  31.51 
 
 		 162 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  33.6 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  31.71 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  33.33 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  32.88 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  31.71 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  29.05 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0944  CheW protein  33.33 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  37 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  38.46 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  34.15 
 
 		 139 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  38.46 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  28.74 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.5 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  34.23 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  37.5 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  29.87 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  28.95 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  27.5 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  27.5 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  35.58 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  29.6 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  32.03 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0689  CheW protein  35.97 
 
 		 333 aa  67  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1944  CheW protein  37.74 
 
 		 425 aa  67  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  28.22 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  33.01 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  33.11 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3496  biotin synthase  30.87 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.296204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  35.11 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  35.25 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>